알파프로테오박테리아(Alphaproteobacteria)는 프로테오박테리아문의 알파프로테오박테리아강에 속하는 세균의 총칭이다.[1][2] 모든 프로테오박테리아들처럼 그람음성균이다..
2013년 펄라 등(Ferla et al.)의 연구에 기반한 알파프로테오박테리아의 계통 분류는 다음과 같다.[3]
알파프로테오박테리아마그네토코쿠스아강
카울로박테리아아강Rhodospirillales, Sphingomonadales, Rhodobacteraceae, Rhizobiales
Holosporales
리케차아강 Pelagibacterales PelagibacteraceaePelagibacter
기타
Proto-mitochondria
아나플라스마과Ehrlichia
Wolbachia
Neorickettsia
MidichloriaceaeMidichloria
리케차과