진흙장어과(Heterenchelyidae)는 뱀장어목에 속하는 조기어류 분류군의 하나이다. 대서양과 지중해 그리고 동태평양에서 발견된다. 진흙장어류는 저생어류로 부드러운 진흙 속으로 파고 들어가는 습성이 있다.[1] 입이 크고 가슴지느러미가 없으며, 몸길이는 32~149 cm 정도이다. 현재 2속 8종으로 이루어져 있다.
2013년 현재, 계통 분류는 다음과 같다.[2]
프로탕구일라과
긴꼬리장어과
스파게티장어과
도요새장어과
케마과
톱니장어과
모노그나투스과
펠리칸장어과
풍선장어과
뱀장어과
긴목장어과 + 클롭시스과 + 붕장어과 + 먹붕장어과
붕장어과 + 오리주둥이장어과
붕장어과
갯장어과
바다뱀과
클롭시스과
진흙장어과
가는장어과
곰치과