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車軸藻植物門(英語: Charophyta)は、車軸藻綱の上位分類である。
従来、車軸藻綱の上位分類は緑藻植物門 (Chlorophyta) であったが、分子系統学が発達するにつれ、車軸藻綱が別系統であることが明確になってくる。この場合、ストレプト植物 (Streptophyta) が、車軸藻類の上位分類となるが、ストレプト植物を門としてしまうと、陸上植物の下位分類との不整合等が生じる。車軸藻植物門はその代わりに組み入れられる場合がある分類階級である。
藻類と陸上植物の分類体系を融合する場合、その周辺に少し工夫が必要である。おおよそ次の3種の体系が考えられる。
このほかには、メソスティグマ藻などの原始的なストレプト植物の群を、所属門なしとする方法等も考えられる。