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Nepovirus is a genus of viruses in the order Picornavirales, in the family Secoviridae, in the subfamily Comovirinae. Plants serve as natural hosts. There are 40 species in this genus.[1][2] Nepoviruses, unlike the other two genera (Comovirus and Fabavirus) in the subfamily Comovirinae, are transmitted by nematodes.[3]
The genus contains the following species:[2]
Viruses in Nepovirus are non-enveloped, with icosahedral geometries, and T=pseudo3 symmetry. The diameter is around 28-30 nm. Genomes are linear and segmented, bipartite, around 23.9kb in length.[1]
Viral replication is cytoplasmic. Entry into the host cell is achieved by penetration into the host cell. Replication follows the positive stranded RNA virus replication model. Positive stranded RNA virus transcription is the method of transcription. The virus exits the host cell by tubule-guided viral movement. Plants serve as the natural host. The virus is transmitted via a vector (nematodes, mite, and thrips). Transmission routes are vector.[1]
Nepoviruses are classified as type IV viruses under the Baltimore classification system, and consequently contain bipartite, linear, single stranded positive sense RNA genomes. The two genome segments are encapsulated separately into two different icosahedral particles. Each of the genome segments produces a different polypeptide, which undergoes a series of steps (i.e. proteolysis, and other post-translational modifications) in order to produce a functional protein.[3]
The first segment (RNA1) is approximately 8,000 nucleotides in length and appears as a single copy in each B type virion. It encodes the proteins that are important in replication and is the first gene to be activated.[3]
The second segment (RNA2) is approximately 4,000–7,000 nucleotides in length and usually appears as a single copy in each M type virion. It encodes the proteins that are important in cell-cell transmission and evasion of cellular defenses.[3]
Nepovirus is a genus of viruses in the order Picornavirales, in the family Secoviridae, in the subfamily Comovirinae. Plants serve as natural hosts. There are 40 species in this genus. Nepoviruses, unlike the other two genera (Comovirus and Fabavirus) in the subfamily Comovirinae, are transmitted by nematodes.
Nepovirus est un genre de virus qui infecte les plantes (phytovirus). Ce genre, rattaché à la famille des Secoviridae et à la sous-famille des Comovirinae, comprend une trentaine d'espèces officiellement décrites, dont le TRSV (Tobacco Ringspot Virus), le virus des taches annulaires du tabac, qui est l'espèce type, et une dizaine d'espèces proposées (provisoires).
Le nom dérive la contraction de nematode transmitted polyhedral viruses (virus polyédrique transmis par les nématodes).
Ce sont des virus à ARN linéaire, à simple brin et à polarité positive (+ssRNA), classés dans le groupe IV de la classification Baltimore.
Le génome, bipartite, est constitué de deux segments d'ARN, ARN1 et ARN2, de 7,5 kb et 3,9 kb respectivement. Les deux segments génomiques sont encapsidés séparément dans des particules distinctes de taille similaire.
Les virions, non enveloppés, sont constitués d'une capside icosaédrique de 28 à 30 nm de diamètre.
Chacun des segments produit une polyprotéine différente, qui subit une série de réactions (protéolyses, et autres modifications post-traductionnelles) aboutissant à des protéines fonctionnelles.
Ces virus, contrairement aux deux autres genres (Comovirus et Fabavirus) de la sous-famille des Comovirinae, sont transmis par des nématodes, principalement de la famille des Longidoridae (genres Longidorus et Xiphinema)[2]. Ils peuvent aussi se disséminer par les graines et le pollen des plantes infectées.
Ils infectent une vaste gamme de plantes-hôtes, appartenant aux dicotylédones.
Nepovirus est un genre de virus qui infecte les plantes (phytovirus). Ce genre, rattaché à la famille des Secoviridae et à la sous-famille des Comovirinae, comprend une trentaine d'espèces officiellement décrites, dont le TRSV (Tobacco Ringspot Virus), le virus des taches annulaires du tabac, qui est l'espèce type, et une dizaine d'espèces proposées (provisoires).
Le nom dérive la contraction de nematode transmitted polyhedral viruses (virus polyédrique transmis par les nématodes).
Ce sont des virus à ARN linéaire, à simple brin et à polarité positive (+ssRNA), classés dans le groupe IV de la classification Baltimore.
Le génome, bipartite, est constitué de deux segments d'ARN, ARN1 et ARN2, de 7,5 kb et 3,9 kb respectivement. Les deux segments génomiques sont encapsidés séparément dans des particules distinctes de taille similaire.
Les virions, non enveloppés, sont constitués d'une capside icosaédrique de 28 à 30 nm de diamètre.
Chacun des segments produit une polyprotéine différente, qui subit une série de réactions (protéolyses, et autres modifications post-traductionnelles) aboutissant à des protéines fonctionnelles.
Ces virus, contrairement aux deux autres genres (Comovirus et Fabavirus) de la sous-famille des Comovirinae, sont transmis par des nématodes, principalement de la famille des Longidoridae (genres Longidorus et Xiphinema). Ils peuvent aussi se disséminer par les graines et le pollen des plantes infectées.
Ils infectent une vaste gamme de plantes-hôtes, appartenant aux dicotylédones.
