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Avian coronavirus ( Inglês )

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Avian coronavirus is a species of virus from the genus Gammacoronavirus that infects birds; since 2018, all gammacoronaviruses which infect birds have been classified as this single species.[3] The strain of avian coronavirus previously known as infectious bronchitis virus (IBV) is the only coronavirus that infects chickens.[3] It causes avian infectious bronchitis, a highly infectious disease that affects the respiratory tract, gut, kidney and reproductive system.[4][5] IBV affects the performance of both meat-producing and egg-producing chickens and is responsible for substantial economic loss within the poultry industry.[6] The strain of avian coronavirus previously classified as Turkey coronavirus causes gastrointestinal disease in turkeys.[3]

Classification

IBV is in the genus Gammacoronavirus,[7] or group 3,[6] with a non-segmented, positive-sense single-stranded RNA genome.[8]

It was previously the type species of its genus Igacovirus.[9] When there was only one genus of coronaviruses, the genus Coronavirus, it was the type species of the group of all known coronaviruses.[10]

Recombination

When two strains of coronavirus IBV infect a host they may recombine during genome replication.[11] Recombination appears to contribute to the genetic variation of the IBV genome found in nature.[12][13]

Pathology

Respiratory system

When inhaled, virus will attach to glycoprotein receptors containing sialic acid on ciliated epithelial cells of the respiratory epithelium. The respiratory replication will result in loss of ciliary activity,[14] mucus accumulation, necrosis and desquamation, causing respiratory distress, râles and asphyxia. Local virus replication will result in viremia, spreading the infection into other tissues and organs. Other respiratory diseases of chickens (Mycoplasma gallisepticum, avian infectious laryngotracheitis (Gallid alphaherpesvirus 1), Newcastle disease (avian paramyxovirus 1), Avian metapneumovirus infection may be confused clinically to infectious bronchitis.

Kidney

Through viremia, some nephrotropic strains (most of high virulence) could infect the kidney epithelium in tubules and nephron, causing kidney failure. At gross examination, kidneys may appear swollen and pale in color and with urates in ureters

Reproductive system

In hens, the viremic IBV will also reach the oviduct, causing lesions in the magnum (the egg-white gland) and in the uterus (the egg-shell gland), leading to a sharp decline of egg production, shell-less, fragile or roughened shells eggs (uterus lesion) with watery whites (magnum lesion). Infection of chickens at puberty, during the oviduct development, will impede oviduct formation and destroy future laying capacity, resulting in "false layers". However, other diseases affecting layer chickens could lead to that condition.[15]

Vaccines

There are both attenuated vaccines and inactivated vaccines available. Their effectiveness is diminished by poor cross-protection. The nature of the protective immune response to IBV is poorly understood, but the surface spike protein, the amino-terminal S1 half, is sufficient to induce good protective immunity. Experimental vector IB vaccines and genetically manipulated IBVs—with heterologous spike protein genes—have produced promising results, including in the context of in ovo vaccination.[6]

See also

References

  1. ^ ICTV 7th Report van Regenmortel, M.H.V., Fauquet, C.M., Bishop, D.H.L., Carstens, E.B., Estes, M.K., Lemon, S.M., Maniloff, J., Mayo, M.A., McGeoch, D.J., Pringle, C.R. and Wickner, R.B. (2000). Virus taxonomy. Seventh report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Academic Press, San Diego.1162 pp. https://ictv.global/ictv/proposals/ICTV%207th%20Report.pdf
  2. ^ a b c d e f de Groot, Raoul J.; et al. (2008). "Revision of the family Coronaviridae" (PDF). p. 24. Retrieved 9 March 2020. Avian coronavirus (new) (comprised of existing species infectious bronchitis virus, turkey coronavirus, pheasant coronavirus, duck coronavirus, goose coronavirus, pigeon coronavirus)
  3. ^ a b c de Wit, J.J. Sjaak; Cook, Jane K.A. (August 2020). "Spotlight on avian coronaviruses". Avian Pathology. 49 (4): 313–316. doi:10.1080/03079457.2020.1761010. PMID 32374218.
  4. ^ Casais, R.; Thiel, V.; Siddell, S.G.; Cavanagh, D.; Britton, P. (2001). "Reverse genetics system for the avian coronavirus infectious bronchitis virus". Journal of Virology. 75 (24): 12359–12369. doi:10.1128/JVI.75.24.12359-12369.2001. PMC 116132. PMID 11711626.
  5. ^ Cavanagh, D. (2001). "A nomenclature for avian coronavirus isolates and the question of species status". Avian Pathology. 30 (2): 109–115. doi:10.1080/03079450120044506. PMID 19184884.
  6. ^ a b c Cavanagh, D (2007). "Coronavirus avian infectious bronchitis virus". Veterinary Research. 38 (2): 281–97. doi:10.1051/vetres:2006055. PMID 17296157.open access
  7. ^ Bande, F; Arshad, SS; Omar, AR; Bejo, MH; Abubakar, MS; Abba, Y (2016). "Pathogenesis and diagnostic approaches of Avian Infectious Bronchitis". Advances in Virology. 2016: 4621659. doi:10.1155/2016/4621659. PMC 4756178. PMID 26955391.
  8. ^ de Vries, A.A.F.; Horzinek, M.C.; Rottier, P.J.M.; de Groot., R.J. (1997). "The genome organisation of the Nidovirales: similarities and differences between arteri-, toro-, and coronaviruses". Seminars in Virology. 8 (1): 33–547. CiteSeerX 10.1.1.462.1825. doi:10.1006/smvy.1997.0104. PMC 7128191. PMID 32288441.
  9. ^ "ICTV Taxonomy history: Avian coronavirus". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Retrieved 20 May 2021.
  10. ^ Cann, Alan, ed. (2006). "Coronaviruses". Microbiology @ Leicester. University of Leicester, School of Biological Sciences. Archived from the original on 9 March 2007. Retrieved 15 June 2020. Family: Coronaviridae; (Subfamily): ; Genus: Coronavirus; Type Species: Infectious bronchits virus
  11. ^ Kottier, S.A.; Cavanagh, D; Britton, P (10 November 1995). "Experimental evidence of recombination in coronavirus infectious bronchitis virus". Virology. 213 (2): 569–80. doi:10.1006/viro.1995.0029. PMC 7131336. PMID 7491781.
  12. ^ Wang, L; Junker, D; Collisson, E.W. (February 1993). "Evidence of natural recombination within the S1 gene of infectious bronchitis virus". Virology. 192 (2): 710–6. doi:10.1006/viro.1993.1093. PMID 8380672.
  13. ^ Jia, W; Karaca, K; Parrish, C.R.; Naqi, S.A. (1995). "A novel variant of avian infectious bronchitis virus resulting from recombination among three different strains". Archives of Virology. 140 (2): 259–71. doi:10.1007/BF01309861. PMC 7086685. PMID 7710354.
  14. ^ "Ciliary activity of chicken tracheal epithelial cells". YouTube. 15 November 2010. Archived from the original on 21 December 2021. Retrieved 23 September 2013.
  15. ^ "Infectious Bronchitis: Introduction". The Merck Veterinary Manual. 2006. Archived from the original on 22 June 2007. Retrieved 17 June 2007.
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Avian coronavirus: Brief Summary ( Inglês )

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Avian coronavirus is a species of virus from the genus Gammacoronavirus that infects birds; since 2018, all gammacoronaviruses which infect birds have been classified as this single species. The strain of avian coronavirus previously known as infectious bronchitis virus (IBV) is the only coronavirus that infects chickens. It causes avian infectious bronchitis, a highly infectious disease that affects the respiratory tract, gut, kidney and reproductive system. IBV affects the performance of both meat-producing and egg-producing chickens and is responsible for substantial economic loss within the poultry industry. The strain of avian coronavirus previously classified as Turkey coronavirus causes gastrointestinal disease in turkeys.

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Coronavirus aviar ( Espanhol; Castelhano )

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El coronavirus aviar es un coronavirus que infecta a las aves y causa la enfermedad asociada, la bronquitis infecciosa. Es un patógeno aviar altamente infeccioso que afecta el tracto respiratorio, el intestino, el riñón y los sistemas reproductivos de los pollos.[1][2]

Afecta el desempeño de los pollos productores de carne y huevos; y es responsable de pérdidas económicas sustanciales dentro de la industria avícola. [3]

Clasificación

Pertenece al género Gammacoronavirus,[4]​ o grupo 3,[3]​ con un genoma de ARN monocatenario de sentido positivo y no segmentado.[5]

Patología

Sistema respiratorio

Cuando se inhala, el virus se unirá a los receptores de glucoproteína que contienen ácido siálico en las células epiteliales ciliadas del epitelio respiratorio. La replicación respiratoria dará como resultado la pérdida de la actividad ciliar, [6]​ acumulación de moco, necrosis y descamación, causando dificultad respiratoria y asfixia. La replicación local del virus provocará viremia y propagará la infección a otros tejidos y órganos. Otras enfermedades respiratorias de los pollos (Mycoplasma gallisepticum, laringotraqueítis infecciosa aviar ( alfaherpesvirus galido 1), enfermedad de Newcastle (paramixovirus aviar 1), la infección por metapneumovirus aviar puede confundirse clínicamente con bronquitis infecciosa.

Riñón

A través de la viremia, algunas cepas nefrotrópicas (la mayoría de alta virulencia) podrían infectar el epitelio renal en los túbulos y la nefrona, causando insuficiencia renal. En el examen general, los riñones pueden aparecer hinchados y de color pálido y con uratos en los uréteres.

Sistema reproductivo

En las gallinas, este virus también alcanzará el oviducto, causando lesiones en el magnum (la glándula de la clara del huevo) y en el útero (la glándula de la cáscara del huevo), lo que lleva a una fuerte disminución de la producción de huevos, sin cáscara, frágil o huevos de cáscara áspera (lesión del útero) con claras acuosas (lesión magnum). La infección de los pollos en la pubertad, durante el desarrollo del oviducto, impedirá la formación del oviducto y destruirá la capacidad de colocación futura, dando como resultado "capas falsas". Sin embargo, otras enfermedades que afectan a las gallinas ponedoras podrían provocar esa afección.[7]

Vacunas

Hay vacunas atenuadas y vacunas inactivadas disponibles. Su eficacia se ve disminuida por la escasa protección cruzada. La naturaleza de la respuesta inmune protectora al coronavirus aviar es poco conocida, pero la proteína de la espiga superficial, la mitad S1 amino terminal, es suficiente para inducir una buena inmunidad protectora. Las vacunas experimentales de vectores IB y los coronavirus aviar manipulados genéticamente, con genes de proteína de espiga heteróloga, han producido resultados prometedores, incluso en el contexto de la vacunación in ovo. [3]

Referencias

  1. Casais, R.; Thiel, V.; Siddell, S.G.; Cavanagh, D.; Britton, P. (2001). «Reverse genetics system for the avian coronavirus infectious bronchitis virus.». Journal of Virology 75 (24): 12359-12369. PMC 116132. PMID 11711626. doi:10.1128/JVI.75.24.12359-12369.2001.
  2. Cavanagh, D. (2001). «A nomenclature for avian coronavirus isolates and the question of species status.». Avian Pathology 30 (2): 109-115. PMID 19184884. doi:10.1080/03079450120044506.
  3. a b c Cavanagh, D (2007). «Coronavirus avian infectious bronchitis virus». Veterinary Research 38 (2): 281-97. PMID 17296157. doi:10.1051/vetres:2006055.
  4. Bande, F; Arshad, SS; Omar, AR; Bejo, MH; Abubakar, MS; Abba, Y (2016). «Pathogenesis and diagnostic approaches of Avian Infectious Bronchitis». Advances in Virology 2016: 4621659. PMC 4756178. PMID 26955391. doi:10.1155/2016/4621659.
  5. de Vries, A.A.F.; Horzinek, M.C.; Rottier, P.J.M.; de Groot., R.J. (1997). «The genome organisation of the Nidovirales: similarities and differences between arteri-, toro-, and coronaviruses.». Seminars in Virology 8: 33-547. doi:10.1006/smvy.1997.0104.
  6. «Ciliary activity of chicken tracheal epithelial cells». YouTube. 15 de noviembre de 2010. Consultado el 23 de septiembre de 2013.
  7. «Infectious Bronchitis: Introduction». The Merck Veterinary Manual. 2006. Archivado desde el original el 22 de junio de 2007. Consultado el 17 de junio de 2007.

Otras lecturas

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Coronavirus aviar: Brief Summary ( Espanhol; Castelhano )

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El coronavirus aviar es un coronavirus que infecta a las aves y causa la enfermedad asociada, la bronquitis infecciosa. Es un patógeno aviar altamente infeccioso que afecta el tracto respiratorio, el intestino, el riñón y los sistemas reproductivos de los pollos.​​

Afecta el desempeño de los pollos productores de carne y huevos; y es responsable de pérdidas económicas sustanciales dentro de la industria avícola. ​

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Coronavirus aviaire ( Francês )

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Le coronavirus aviaire, anciennement virus de la bronchite infectieuse aviaire (IBV, d'après infectious bronchitis virus), est un coronavirus qui infecte la volaille, causant la maladie associée, la bronchite infectieuse.

C'est un agent pathogène aviaire hautement infectieux qui affecte l'appareil respiratoire, le tube digestif, les reins et le système reproducteur des poulets[3],[4].

La maladie provoque de graves pertes économiques via un effondrement du taux de ponte (sans tuer les poules), et les mesures de biosécurité classiques ne contrôlent pas ou mal ce virus très contagieux. La vaccination a été la seule réponse efficace, appliquée dans les élevages industriels du monde entier[5].

Histoire

Cette première coronavirose, a été décrite en 1931.

Classification

L'IBV est un coronavirus dont le génome non segmenté est constitué d'un ARN simple brin à polarité positive (ssRNA)[6].

Pathologie

Ce virus, comme d'autres coronavirus (virus de l'hépatite de la souris qui infecte des mammifère ou le virus du syndrome respiratoire aigu sévère ou SARS-CoV-1 qui infecte l'humain)[7] est capable de détourner à son profit le mécanisme intracellulaire de l'autophagie (qui est l'une des réponses cellulaires naturelles aux anomalies qui apparaissent dans une cellule, dont l'infection par un virus).

En temps normal des autophagosomes sont chargés de transporter des organites cellulaires et notamment des protéines devenus inutiles ou dégradés ou mal conformés ver les lysosomes pour la dégradation et le recyclage ou élimination des acides aminés ou autres molécules qu'ils contiennent[7]. La dégradation par autophagie est aussi l'une des formes de défense innée contre les virus qui sont alors emprisonnés et digérés dans la cellule même[7], mais le Virus de la bronchite infectieuse aviaire dispose d'un gène (nsp6, retrouvé chez d'autres coronavirus) capable de reprogrammer au profit du virus la machinerie (intracellulaire) de l'autophagie : le virus utilise alors les autophagosomes de la cellule pour acheminer et produire les protéines de réplicase[7] dont il a besoin.

Empêcher le virus d'utiliser de détourner à son profit la machinerie de l'autophagie est une piste médicamenteuse qui avait été envisagée à la suite de la pandémie de SRAS[7], à nouveau soulevée en 2020 dans le cadre de la pandémie[8],[9].

Système respiratoire

Quand le virus est inhalé, il s'attache aux cellules de l'épithélium cilié de l'appareil respiratoire. La réplication virale commence alors, et les particules virales essaiment dans les vaisseaux sanguins provoquant une virémie.

Ce processus conduit à la nécrose de l'appareil respiratoire, provoquant une toux et des râles.

Reins

Par la virémie, certaines souches néphrotropiques (pour la plupart très virulentes) peuvent pénétrer dans les reins. Cela provoque un gonflement des reins, et l'apparition d'urolithiase. Les reins prennent une couleur pâle. Au microscope on peut détecter la présence de cristaux d'acide urique dans les tubules rénaux ou dans l'uretère.

Système reproducteur

La virémie entraîne également une diminution de la production des œufs. L'accumulation d'un exsudat blanc et collant peut colmater le cloaque. Dans certains cas, les follicules ovariens peuvent se retrouver dans la cavité péritonéale. Toutefois, cette lésion n'est pas spécifique de la bronchite infectieuse. De nombreuses maladies aiguës de layer peuvent conduire à ces symptômes[10].

Vaccination

Un premier vaccin vétérinaire a d'abord été mis au point contre le sérotype « Massachusetts », mais des « variants » résistants à ce vaccin sont rapidement apparus, grâce à une mutation du gène codant la glycoprotéine de spicule S1 du virus[5].

Une surveillance vétérinaire épidémiologique de la maladie a ensuite permis d'identifier plus rapidement les « variants » circulant dans les élevages touchés, pour adapter les vaccins (utilisation de vaccins recombinants intégrant les virus mutants)[5].

Notes et références

  1. ICTV 7th Report van Regenmortel, M.H.V., Fauquet, C.M., Bishop, D.H.L., Carstens, E.B., Estes, M.K., Lemon, S.M., Maniloff, J., Mayo, M.A., McGeoch, D.J., Pringle, C.R. and Wickner, R.B. (2000). Virus taxonomy. Seventh report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Academic Press, San Diego.1162 pp. https://talk.ictvonline.org/ictv/proposals/ICTV%207th%20Report.pdf
  2. a b c d e et f (en) Raoul J. de Groot et al., « Revision of the family Coronaviridae », 2008 (consulté le 9 mars 2020) : « Avian coronavirus (new) ( [sic] existing species infectious bronchitis virus, turkey coronavirus, pheasant coronavirus, duck coronavirus, goose coronavirus, pigeon coronavirus) », p. 24
  3. (en) Casais, R., Thiel, V.,, Siddell, S.G., Cavanagh, D., Britton, P., « Reverse genetics system for the avian coronavirus infectious bronchitis virus. », Journal of Virology, vol. 75, no 24,‎ 2001, p. 12359–12369 (PMID , PMCID , DOI )
  4. (en) Cavanagh, D., « A nomenclature for avian coronavirus isolates and the question of species status. », Avian Pathology, vol. 30, no 2,‎ 2001, p. 109–115 (PMID , DOI )
  5. a b et c « Communiqué de l’Académie nationale de médecine et de l’Académie vétérinaire de France : Mutation du virus Sars-CoV-2 chez les visons danois et mesures de précaution – Académie nationale de médecine » (consulté le 13 novembre 2020)
  6. (en) de Vries, A.A.F., Horzinek, M.C., Rottier, P.J.M., de Groot., R.J., « The genome organisation of the Nidovirales: similarities and differences between arteri-, toro-, and coronaviruses. », Seminars in Virology, vol. 8,‎ 1997, p. 33–547 (DOI )
  7. a b c d et e (en) Eleanor M. Cottam et Helena J. Maier, « Coronavirus nsp6 proteins generate autophagosomes from the endoplasmic reticulum via an omegasome intermediate », sur Autophagy, novembre 2011 (ISSN , PMID , PMCID , DOI , consulté le 22 mai 2020), p. 1335–1347
  8. (en) Yang N et Shen Hm, « Targeting the Endocytic Pathway and Autophagy Process as a Novel Therapeutic Strategy in COVID-19 », sur International journal of biological sciences, 15 mars 2020 (PMID , PMCID , DOI , consulté le 22 mai 2020)
  9. Didac Carmona-Gutierrez et Maria A. Bauer, « Digesting the crisis: autophagy and coronaviruses », sur Microbial Cell, 4 mai 2020 (PMID , PMCID , DOI , consulté le 22 mai 2020), p. 119–128
  10. (en) « Infectious Bronchitis: Introduction », The Merck Veterinary Manual, 2006 (consulté le 10 mars 2011)
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Coronavirus aviaire: Brief Summary ( Francês )

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Le coronavirus aviaire, anciennement virus de la bronchite infectieuse aviaire (IBV, d'après infectious bronchitis virus), est un coronavirus qui infecte la volaille, causant la maladie associée, la bronchite infectieuse.

C'est un agent pathogène aviaire hautement infectieux qui affecte l'appareil respiratoire, le tube digestif, les reins et le système reproducteur des poulets,.

La maladie provoque de graves pertes économiques via un effondrement du taux de ponte (sans tuer les poules), et les mesures de biosécurité classiques ne contrôlent pas ou mal ce virus très contagieux. La vaccination a été la seule réponse efficace, appliquée dans les élevages industriels du monde entier.

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