dcsimg

Chlamydomonas reinhardtii ( catalan ; valencien )

fourni par wikipedia CA

Chlamydomonas reinhardtii és una alga verda unicel·lular que es fa servir d'organisme model. Mesura uns 10 micròmetres de diàmetre amb dos flagels. La seva paret cel·lular està feta de glucoproteïnes riques en hidroxiprolina, un gran cloroplast en forma de copa, un gran pirenoide, i una taca que detecta la llum (fotosensible). Aquesta alga té una distribució cosmopolita en sòls i aigua dolça. També és d'interès com biocombustible per la producció d'hidrogen. Aquesta espècie d'alga no només fa la fotosíntesi sinó que pot capturar energia d'altres plantes (digerint la cel·lulosa), essent la primera vegada que s'ha observat això en un vegetal i això pot tenir un gran impacte en el futur de la bioenergia.[1][2]

Es va començar a estudiar en laboratori a partir de 1945 .[3][4]

Organisme model

Les Chlamydomonas es fan servir per contestar les preguntes de la biologia cel·lular i la biologia molecular referides al moviment, resposta a la llum, reconeixement, regulació del proteoma per controlar els flagels, resposta als canvis en nutrició mineral. Es fan servir molts mutants d'aquesta espècie per estudiar per exemple la fotosíntesi, la síntesi de proteïnes o l'evolució dels organismes.

Reproducció

Les cèl·lules vegetatives de C. reinhardtii són haploides amb 17 cromosomes petits. Sota privació de nitrogen es desenvolupen gàmetes haploides. Els progenitors són d'aparença idèntica (s'anomenen mt(+) i mt(-)), que es fusionen per donar un zigot diploide. Aquest zigot no està flagellat i és inactiu al sòl. Amb la llum el zigot experimenta la meiosi i allibera quatre cèl·lules flagelades haploides. Sota condicions ideals les cèl·lules poden de vegades tenir dos o tres cicles de mitosi i així es pot tenir de 4 a 8 cèl·lules filles per cada cèl·lula materna. El seu cicle cel·lular es pot sincronitzar alternant períodes de llum i foscor.[5]

Notes

  1. Revista online Nature communications de 20 de novembre de 2012
  2. http://www.sciencedaily.com/releases/2012/11/121120121913.htm
  3. «CC-125 wild type mt+ 137c». Chlamydomonas Center core collection list.
  4. The Chlamydononas Sourcebook, ISBN 978-0-12-370873-1)
  5. Oldenhof, H, Zachleder, V. and van den Ende, H. 2006. Blue- and red-light regulation of the cell cycle in Chlamydomonas reinhardtii (Chlorophyta). Eur. J. Phycol. 41: 313 - 320

Bibliografia

  • Aoyama, H., Kuroiwa, T. and Nakamura, S. 2009. The dynamic behaviour of mitochondria in living zygotes during maturation and meiosis in Chlamydomonas reinhardtii. Eur. J. Phycol. 44: 497 - 507.
  • Jamers, A., Lenjou, M., Deraedt, P., van Bockstaele, D., Blust, R. and de Coen, W. 2009. Flow cytometric analysis of the cadmium-exposed green algae Chlamydomonas reinhadtii (Chlorophyceae). Eur. J. Phcol. 44: 54 - 550.

Enllaços externs

 src= A Wikimedia Commons hi ha contingut multimèdia relatiu a: Chlamydomonas reinhardtii Modifica l'enllaç a Wikidata
licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Autors i editors de Wikipedia
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia CA

Chlamydomonas reinhardtii: Brief Summary ( catalan ; valencien )

fourni par wikipedia CA

Chlamydomonas reinhardtii és una alga verda unicel·lular que es fa servir d'organisme model. Mesura uns 10 micròmetres de diàmetre amb dos flagels. La seva paret cel·lular està feta de glucoproteïnes riques en hidroxiprolina, un gran cloroplast en forma de copa, un gran pirenoide, i una taca que detecta la llum (fotosensible). Aquesta alga té una distribució cosmopolita en sòls i aigua dolça. També és d'interès com biocombustible per la producció d'hidrogen. Aquesta espècie d'alga no només fa la fotosíntesi sinó que pot capturar energia d'altres plantes (digerint la cel·lulosa), essent la primera vegada que s'ha observat això en un vegetal i això pot tenir un gran impacte en el futur de la bioenergia.

Es va començar a estudiar en laboratori a partir de 1945 .

licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Autors i editors de Wikipedia
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia CA

Chlamydomonas reinhardtii ( allemand )

fourni par wikipedia DE

Chlamydomonas reinhardtii ist eine einzellige Grünalgenart aus der Gattung Chlamydomonas. Sie wurde von der Sektion Phykologie der Deutschen Botanischen Gesellschaft als Alge des Jahres 2014 ausgewählt.[1]

Beschreibung

 src=
Transmissionselektronenmikroskopische Aufnahme eines Schnitts durch C. reinhardtii
 src=
Zeichnung eines TEM-Schnitts
1. Geißel, 2. Mitochondrium, 3. Kontraktile Vakuole, 4. Augenfleck, 5. becherförmiger Chloroplast, 6. Golgi-Apparat, 7. Stärkekörner, 8. Pyrenoid, 9. Vakuole, 10. Zellkern, 11. Endoplasmatisches Retikulum, 12. Zellmembran, 13. Zellwand

Chlamydomonas reinhardtii ist ein 3 bis 10 Mikrometer großer Hüllenflagellat mit eiförmiger Gestalt. Die beiden gleich langen (isokonten) Geißeln dienen der Fortbewegung. Die Schläge der Geißeln erfolgen nacheinander, und zwar mit einer kleinen Verzögerung. Dadurch entsteht eine Überlagerung ihrer Vorwärtsbewegung durch eine Rotation um die Längsachse der Alge mit einer Frequenz von etwa 1 Hertz. Die Fortbewegung der Zelle ist lichtgesteuert.

Die Zellmembran ist an der Vorderseite nicht zu einer Papille verdickt. Der Chloroplast besitzt ein großes Pyrenoid.

Es ist ein Augenfleck (Stigma) von etwa 1 Mikrometer Durchmesser vorhanden. Er ist durch eingelagerte Carotinoide orange gefärbt und gut erkennbar. Der Augenfleck liegt mit einem Abstand von etwa 10 Mikrometer von den Geißeln leicht oberhalb des Zelläquators. Als Photorezeptor sind Rhodopsin-ähnliche Proteine, sogenannte Channelrhodopsine, darin eingelagert.

Lebensraum

Die Art lebt im Süßwasser, man findet sie vor allem in nährstoffreichen Kleingewässern. Sie ist weltweit verbreitet.

Fortpflanzung

Die Alge kann sich sowohl vegetativ als auch geschlechtlich durch Gameten vermehren.[2] Die geschlechtliche Fortpflanzung wird durch Nährstoffmangel (insbesondere Stickstoffmangel) induziert. Dabei ist die Zygote das einzige diploide Stadium, das widrige Umstände überdauert und beim Keimen nach einer Meiose wieder haploide Nachkommen hervorbringt.

Lichtgesteuertes Verhalten

Chlamydomonas reinhardtii besitzt mit dem Augenfleck einen lichtsensitiven Apparat zur Phototaxis. Die Alge kann die Richtung und die Intensität von einfallendem Licht ermitteln. Bei niedriger Beleuchtungsstärke schwimmt sie auf die Lichtquelle zu, bei hoher Intensität von dieser weg. Dadurch optimiert sie ihre Photosynthese und damit die Zellernährung.[3] Die Alge kann sowohl phototroph (unter Ausnutzung des Lichtes) als auch heterotroph (auf Nährmedium) leben.

Bedeutung als Forschungsobjekt

Die Geißeln von C. reinhardtii sind ebenso aufgebaut wie die menschlicher Spermien und vieler anderer Lebewesen. Diese Alge wurde als Modellorganismus für das Studium der Struktur und Funktion der Geißeln gewählt, weil sie sich sehr leicht kultivieren lässt und weil sie etwa durch einen pH-Schock zum Abwerfen der Geißeln veranlasst werden kann.[4]

Das Genom von C. reinhardtii ist vollständig sequenziert.[5] Zu Forschungszwecken wurden viele unterschiedliche Mutanten des Wildtyps gezüchtet, die zum Beispiel Zellwanddefekte aufweisen oder „blind“ sind.[6]

Ein Forschungsschwerpunkt ist die genetische Modifikation von C.reinhardtii hin zu Stämmen, die in industriell nutzbarem Maße Wasserstoff erzeugen können. Parallel dazu gibt es eine Reihe von wissenschaftlichen Projekten zur Entwicklung von leistungsfähigen Bioreaktoren zur Wasserstoffproduktion.[7]

Interessant erscheint auch die Fähigkeit, Cellulose zu spalten und zur Energiegewinnung zu nutzen.[8] Die Alge könnte somit als Biokatalysator für die Herstellung von Cellulose-Biokraftstoffen (z. B. Cellulose-Ethanol) dienen.

In einer 2021 veröffentlichten Studie konnte gezeigt werden, dass infolge Selektionsdruck durch Fressfeinde innerhalb von nur 500 Generationen Mutationen entstanden, die C. reinhardtii zur Bildung von Kolonien befähigten.[9]

Literatur

Einzelnachweise

  1. Sektion Phykologie der Deutschen Botanischen Gesellschaft (DBG) e.V: Alge des Jahres 2014: Chlamydomonas reinhardtii - schneller Schwimmer steht Modell (Pressemitteilung) (Memento des Originals vom 4. März 2016 im Internet Archive)  src= Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/www.dbg-phykologie.de
  2. Photoorientierung begeißelter Grünalgen. (Memento des Originals vom 25. April 2013 im Internet Archive)  src= Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/www.zellbio.nat.uni-erlangen.deForschungsprojekt der Universität Erlangen-Nürnberg mit kurzer Darstellung zum Forschungsstand, abgerufen am 6. April 2011.
  3. Erhard Kühnle: Studium Ionaler Prozesse bei der Phototransduktion der einzelligen Alge Chlamydomonas reinhardtii. Wissenschaftliche Forschungsbeiträge Biologie/Biochemie/Chemie Bd. 47. Verlag Intemann, Prien 1990. ISBN 3-926323-51-5
  4. Robert Edward Lee: Phycology. 5. Aufl., Cambridge University Press, Cambridge 2018, S. 3.
  5. Merchant et al.; Prochnik, SE; Vallon, O; Harris, EH; Karpowicz, SJ; Witman, GB; Terry, A; Salamov, A et al.: The Chlamydomonas Genome Reveals the Evolution of Key Animal and Plant Functions Science 318 (2007): 245–250. PMC 2875087 (freier Volltext)
  6. Homepage des Chlamydomonas-Center, abgerufen am 6. April 2011.
  7. Karin Hollricher: Wasserstoff aus der Alge. In: Laborjournal 04/2010. F+R Internet Agentur, Freiburg, deutsch, abgerufen am 8. April 2011.
  8. Olga Blifernez-Klassen, Viktor Klassen u. a.: Cellulose degradation and assimilation by the unicellular phototrophic eukaryote Chlamydomonas reinhardtii. In: Nature Communications. 3, Artikel: 1214, 2012, doi:10.1038/ncomms2210, Pflanzen fressen Pflanzen auf pflanzenforschung.de, abgerufen am 3. März 2017.
  9. Joana P. Bernardes, Uwe John, Noemi Woltermann, Martha Valiadi, Ruben J. Hermann, Lutz Becks: The evolution of convex trade-offs enables the transition towards multicellularity, in: Nature Communications, Band 12, 4222, 9. Juli 2021, doi:10.1038/s41467-021-24503-z. Dazu: Elena Bernard: Evolution in Echtzeit: Einzellige Grünalge vollzieht in nur 500 Generationen die ersten Schritte zur Mehrzelligkeit, auf scinexx.de vom 19. Juli 2021
licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Autoren und Herausgeber von Wikipedia
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia DE

Chlamydomonas reinhardtii: Brief Summary ( allemand )

fourni par wikipedia DE

Chlamydomonas reinhardtii ist eine einzellige Grünalgenart aus der Gattung Chlamydomonas. Sie wurde von der Sektion Phykologie der Deutschen Botanischen Gesellschaft als Alge des Jahres 2014 ausgewählt.

licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Autoren und Herausgeber von Wikipedia
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia DE

Chlamydomonas reinhardtii ( anglais )

fourni par wikipedia EN

Chlamydomonas reinhardtii is a single-cell green alga about 10 micrometres in diameter that swims with two flagella. It has a cell wall made of hydroxyproline-rich glycoproteins, a large cup-shaped chloroplast, a large pyrenoid, and an eyespot that senses light.

Chlamydomonas species are widely distributed worldwide in soil and fresh water. Chlamydomonas reinhardtii is an especially well studied biological model organism, partly due to its ease of culturing and the ability to manipulate its genetics. When illuminated, C. reinhardtii can grow photoautotrophically, but it can also grow in the dark if supplied with organic carbon. Commercially, C. reinhardtii is of interest for producing biopharmaceuticals and biofuel, as well being a valuable research tool in making hydrogen.

History

The C. reinhardtii wild-type laboratory strain c137 (mt+) originates from an isolate collected near Amherst, Massachusetts, in 1945 by Gilbert M. Smith.[1][2]

The species' name has been spelled several different ways because of different transliterations of the name from Russian: reinhardi, reinhardii, and reinhardtii all refer to the same species, C. reinhardtii Dangeard.[3]

Model organism

Cross section of a Chlamydomonas reinhardtii cell

Chlamydomonas is used as a model organism for research on fundamental questions in cell and molecular biology such as:

  • How do cells move?
  • How do cells respond to light?
  • How do cells recognize one another?
  • How do cells generate regular, repeatable flagellar waveforms?
  • How do cells regulate their proteome to control flagellar length?
  • How do cells respond to changes in mineral nutrition? (nitrogen, sulfur, etc.)

There are many known mutants of C. reinhardtii. These mutants are useful tools for studying a variety of biological processes, including flagellar motility, photosynthesis, and protein synthesis. Since Chlamydomonas species are normally haploid, the effects of mutations are seen immediately without further crosses.

In 2007, the complete nuclear genome sequence of C. reinhardtii was published.[4]

Channelrhodopsin-1 and Channelrhodopsin-2, proteins that function as light-gated cation channels, were originally isolated from C. reinhardtii.[5][6] These proteins and others like them are increasingly widely used in the field of optogenetics.[7]

Mitochondrial significance

The genome of C. reinhardtii is significant for mitochondrial study as it is one species where the genes for 6 of the 13 proteins encoded for the mitochondria are found in the nucleus of the cell, leaving 7 in the mitochondria. In all other species these genes are present only in the mitochondria and are unable to be allotopically expressed. This is significant for the testing and development of therapies for genetic mitochondrial diseases.

Reproduction

Vegetative cells of reinhardtii species are haploid with 17 small chromosomes. Under nitrogen starvation, vegetative cells differentiate into haploid gametes.[8] There are two mating types, identical in appearance, thus isogamous, and known as mt(+) and mt(-), which can fuse to form a diploid zygote. The zygote is not flagellated, and it serves as a dormant form of the species in the soil. In the light, the zygote undergoes meiosis and releases four flagellated haploid cells that resume the vegetative lifecycle.

Under ideal growth conditions, cells may sometimes undergo two or three rounds of mitosis before the daughter cells are released from the old cell wall into the medium. Thus, a single growth step may result in 4 or 8 daughter cells per mother cell.

The cell cycle of this unicellular green algae can be synchronized by alternating periods of light and dark. The growth phase is dependent on light, whereas, after a point designated as the transition or commitment point, processes are light-independent.[9]

Eye spot

C. reinhardtii has an eyespot similar to that of dinoflagellates.[10] The eyespot is located near the cell equator. It is composed of a carotenoid-rich granule layer in the chloroplast which act like a light reflector.[11] The main function of the eyespot is the phototaxis, which consist of the movement (with the flagella) related to a light stimulus.[12] The phototaxis is crucial for the alga and allows for localization of the environnement with optimal light conditions for photosynthesis.[13] Phototaxis can be positive or negative depending on the light intensity.[10] The phototactic pathway consists of four steps leading to a change in the beating balance between the two flagella (the cis-flagellum which is the one closest to the eyespot, and the trans-flagellum which is the one farthest from the eyespot).[12]

Genetics

The attractiveness of the algae as a model organism has recently increased with the release of several genomic resources to the public domain. The Chlre3 draft of the Chlamydomonas nuclear genome sequence prepared by Joint Genome Institute of the U.S. Dept of Energy comprises 1557 scaffolds totaling 120 Mb. Roughly half of the genome is contained in 24 scaffolds all at least 1.6 Mb in length. The current assembly of the nuclear genome is available online.[14]

The ~15.8 Kb mitochondrial genome (database accession: NC_001638) is available online at the NCBI database.[15] The complete ~203.8 Kb chloroplast genome (database accession: NC_005353) is available online.[16][17]

In addition to genomic sequence data, there is a large supply of expression sequence data available as cDNA libraries and expressed sequence tags (ESTs). Seven cDNA libraries are available online.[18] A BAC library can be purchased from the Clemson University Genomics Institute.[19] There are also two databases of>50 000[20] and>160 000[21] ESTs available online.

A genome-wide collection of mutants with mapped insertion sites covering most nuclear genes[22][23] is available: https://www.chlamylibrary.org/.

The genome of C. reinhardtii has been shown to contain N6-Methyldeoxyadenosine (6mA), a mark common in prokaryotes but much rarer in eukaryotes.[24] Some research has indicated that 6mA in Chlamydomonas may be involved in nucleosome positioning, as it is present in the linker regions between nucleosomes as well as near the transcription start sites of actively transcribed genes.[25]

C. reinhardtii appears to be capable of several DNA repair processes.[26] These include recombinational repair, strand break repair and excision repair.

Experimental evolution

Chlamydomonas has been used to study different aspects of evolutionary biology and ecology. It is an organism of choice for many selection experiments because (1) it has a short generation time, (2) it is both an autotroph and a facultative heterotroph, (3) it can reproduce both sexually and asexually, and (4) there is a wealth of genetic information already available.

Some examples (nonexhaustive) of evolutionary work done with Chlamydomonas include the evolution of sexual reproduction,[27] the fitness effect of mutations,[28] and the effect of adaptation to different levels of CO2.[29]

According to one frequently cited theoretical hypothesis,[30] sexual reproduction (in contrast to asexual reproduction) is adaptively maintained in benign environments because it reduces mutational load by combining deleterious mutations from different lines of descent and increases mean fitness. However, in a long-term experimental study of C. reinhardtii, evidence was obtained that contradicted this hypothesis. In sexual populations, mutation clearance was not found to occur and fitness was not found to increase.[31]

Motion

C. reinhardtii trajectory, in HSA (culture medium), under red light.

C. reinhardtii swims thanks to its two flagella,[32] in a movement analogous to human breaststroke. Repeating this elementary movement 50 times per second the algae have a mean velocity of 70 µm/s;[33] the genetic diversity of the different strains results in a huge range of values for this quantity. After few seconds of run, an asynchronous beating of the two flagella leads to a random change of direction, a movement called "run and tumble".[32] At a larger time and space scale, the random movement of the alga can be described as an active diffusion phenomenon.[34]

DNA transformation techniques

Gene transformation occurs mainly by homologous recombination in the chloroplast and heterologous recombination in the nucleus. The C. reinhardtii chloroplast genome can be transformed using microprojectile particle bombardment or glass bead agitation, however this last method is far less efficient. The nuclear genome has been transformed with both glass bead agitation and electroporation. The biolistic procedure appears to be the most efficient way of introducing DNA into the chloroplast genome. This is probably because the chloroplast occupies over half of the volume of the cell providing the microprojectile with a large target. Electroporation has been shown to be the most efficient way of introducing DNA into the nuclear genome with maximum transformation frequencies two orders of magnitude higher than obtained using glass bead method.

Production of biopharmaceuticals

Genetically engineered C. reinhardtii has been used to produce a mammalian serum amyloid protein (needs citation), a human antibody protein (needs citation), human Vascular endothelial growth factor, a potential therapeutic Human Papillomavirus 16 vaccine,[35] a potential malaria vaccine (an edible algae vaccine),[36] and a complex designer drug that could be used to treat cancer.[37]

Alternative protein source

C. reinhardtii is in production as a new algae-based nutritional source. Compared to Chlorella and Spirulina, C. reinhardtii was found to have more Alpha-linolenic acid, and a lower quantity of heavy metals while also containing all the essential amino acids and similar protein content.[38] Triton Algae Innovations is developing a commercial alternative protein product made from C reinhardtii.

Clean source of hydrogen production

In 1939, the German researcher Hans Gaffron (1902–1979), who was at that time attached to the University of Chicago, discovered the hydrogen metabolism of unicellular green algae. C reinhardtii and some other green algae can, under specified circumstances, stop producing oxygen and convert instead to the production of hydrogen. This reaction by hydrogenase, an enzyme active only in the absence of oxygen, is short-lived. Over the next thirty years, Gaffron and his team worked out the basic mechanics of this photosynthetic hydrogen production by algae.[39]

To increase the production of hydrogen, several tracks are being followed by the researchers.

  • The first track is decoupling hydrogenase from photosynthesis. This way, oxygen accumulation can no longer inhibit the production of hydrogen. And, if one goes one step further by changing the structure of the enzyme hydrogenase, it becomes possible to render hydrogenase insensitive to oxygen. This makes a continuous production of hydrogen possible. In this case, the flux of electrons needed for this production no longer comes from the production of sugars but is drawn from the breakdown of its own stock of starch.[40]
  • A second track is to interrupt temporarily, through genetic manipulation of hydrogenase, the photosynthesis process. This inhibits oxygen's reaching a level where it is able to stop the production of hydrogen.[41]
  • The third track, mainly investigated by researchers in the 1950s, is chemical or mechanical methods of removal of O2 produced by the photosynthetic activity of the algal cells. These have included the addition of O2 scavengers, the use of added reductants, and purging the cultures with inert gases.[42] However, these methods are not inherently scalable, and may not be applicable to applied systems. New research has appeared on the subject of removing oxygen from algae cultures, and may eliminate scaling problems.
  • The fourth track has been investigated, namely using copper salts to decouple hydrogenase action from oxygen production.[43]
  • The fifth track has been suggested to reroute the photosynthetic electron flow from CO2 fixation in Calvin cycle to hydrogenase by applying short light pulses to anaerobic algae[44] or by depleting the culture of CO2.[45]

See also

References

  1. ^ "CC-125 wild type mt+ 137c". Chlamydomonas Center core collection list. Archived from the original on 2009-07-27. Retrieved 2009-03-09.
  2. ^ The Chlamydomonas Sourcebook, ISBN 978-0-12-370873-1)
  3. ^ http://megasun.bch.umontreal.ca/protists/chlamy/taxonomy.html Chlamydomonas Taxonomy.
  4. ^ Merchant; Prochnik, SE; Vallon, O; Harris, EH; Karpowicz, SJ; Witman, GB; Terry, A; Salamov, A; et al. (2007). "The Chlamydomonas Genome Reveals the Evolution of Key Animal and Plant Functions". Science. 318 (5848): 245–250. Bibcode:2007Sci...318..245M. doi:10.1126/science.1143609. PMC 2875087. PMID 17932292.
  5. ^ Nagel G, Ollig D, Fuhrmann M, et al. (June 28, 2002). "Channelrhodopsin-1: a light-gated proton channel in green algae". Science. 296 (5577): 2395–8. Bibcode:2002Sci...296.2395N. doi:10.1126/science.1072068. PMID 12089443. S2CID 206506942.
  6. ^ Lagali PS, Balya D, Awatramani GB, Münch TA, Kim DS, Busskamp V, Cepko CL, Roska B (June 2008). "Light-activated channels targeted to ON bipolar cells restore visual function in retinal degeneration". Nature Neuroscience. 11 (6): 667–75. doi:10.1038/nn.2117. PMID 18432197. S2CID 6798764.
  7. ^ Boyden ES, et al. (May 3, 2011). "A history of optogenetics: the development of tools for controlling brain circuits with light". F1000 Biology Reports. 3 (11): 11. doi:10.3410/B3-11. PMC 3155186. PMID 21876722.
  8. ^ SAGER R, GRANICK S (July 1954). "Nutritional control of sexuality in Chlamydomonas reinhardi". J. Gen. Physiol. 37 (6): 729–42. doi:10.1085/jgp.37.6.729. PMC 2147466. PMID 13174779.
  9. ^ Oldenhof H.; Zachleder V.; den Ende H. (2006). "Blue- and red-light regulation of the cell cycle in Chlamydomonas reinhardtii (Chlorophyta)". Eur. J. Phycol. 41 (3): 313–320. doi:10.1080/09670260600699920.
  10. ^ a b Ueki, Noriko; Ide, Takahiro; Mochiji, Shota; Kobayashi, Yuki; Tokutsu, Ryutaro; Ohnishi, Norikazu; Yamaguchi, Katsushi; Shigenobu, Shuji; Tanaka, Kan; Minagawa, Jun; Hisabori, Toru; Hirono, Masafumi; Wakabayashi, Ken-Ichi (2016). "Eyespot-dependent determination of the phototactic sign in Chlamydomonas reinhardtii". Proceedings of the National Academy of Sciences. 113 (19): 5299–5304. Bibcode:2016PNAS..113.5299U. doi:10.1073/pnas.1525538113. PMC 4868408. PMID 27122315.
  11. ^ Foster, K.W. and Smyth, R.D. (1980) "Light Antennas in phototactic algae". Microbiological reviews, 44(4): 572–630.
  12. ^ a b Hegemann P, Berthold P (2009) ""Sensory photoreceptors and light control of flagellar activity". In: Stern D, Witman G (Eds) The Chlamydomonas Sourcebook, second edition, volume 3, pages 395–430, Academic, Oxford. ISBN 9780123708731.
  13. ^ Demmig-Adams, B.; Adams, W. W. (1992). "Photoprotection and Other Responses of Plants to High Light Stress". Annual Review of Plant Physiology and Plant Molecular Biology. 43: 599–626. doi:10.1146/annurev.pp.43.060192.003123.
  14. ^ "Home - Chlamydomonas reinhardtii v3.0".
  15. ^ "Chlamydomonas reinhardtii mitochondrion, complete genome". February 2010. {{cite journal}}: Cite journal requires |journal= (help)
  16. ^ "Chlamydomonas reinhardtii chloroplast, complete genome". 2004-01-23. {{cite journal}}: Cite journal requires |journal= (help)
  17. ^ "Chlamydomonas Chloroplast Genome Portal".
  18. ^ "Chlamydomonas Center - Libraries". Archived from the original on 2004-10-19. Retrieved 2006-09-28.
  19. ^ "CUGI". Archived from the original on 2014-12-26. Retrieved 2006-04-03.
  20. ^ "[KDRI]Chlamydomonas reinhardtii EST index".
  21. ^ "Search". Archived from the original on 2005-02-04. Retrieved 2006-09-28.
  22. ^ Li, Xiaobo; Zhang, Ru; Patena, Weronika; Gang, Spencer S.; Blum, Sean R.; Ivanova, Nina; Yue, Rebecca; Robertson, Jacob M.; Lefebvre, Paul A.; Fitz-Gibbon, Sorel T.; Grossman, Arthur R.; Jonikas, Martin C. (2016-02-01). "An Indexed, Mapped Mutant Library Enables Reverse Genetics Studies of Biological Processes in Chlamydomonas reinhardtii". The Plant Cell. 28 (2): 367–387. doi:10.1105/tpc.15.00465. ISSN 1040-4651. PMC 4790863. PMID 26764374.
  23. ^ Li, Xiaobo; Patena, Weronika; Fauser, Friedrich; Jinkerson, Robert E.; Saroussi, Shai; Meyer, Moritz T.; Ivanova, Nina; Robertson, Jacob M.; Yue, Rebecca; Zhang, Ru; Vilarrasa-Blasi, Josep; Wittkopp, Tyler M.; Ramundo, Silvia; Blum, Sean R.; Goh, Audrey; Laudon, Matthew; Srikumar, Tharan; Lefebvre, Paul A.; Grossman, Arthur R.; Jonikas, Martin C. (April 2019). "A genome-wide algal mutant library and functional screen identifies genes required for eukaryotic photosynthesis". Nature Genetics. 51 (4): 627–635. doi:10.1038/s41588-019-0370-6. ISSN 1546-1718. PMC 6636631. PMID 30886426.
  24. ^ Hattman, S; Kenny, C; Berger, L; Pratt, K (September 1978). "Comparative study of DNA methylation in three unicellular eucaryotes". Journal of Bacteriology. 135 (3): 1156–7. doi:10.1128/JB.135.3.1156-1157.1978. PMC 222496. PMID 99431.
  25. ^ Fu, Ye; Luo, Guan-Zheng; Chen, Kai; Deng, Xin; Yu, Miao; Han, Dali; Hao, Ziyang; Liu, Jianzhao; Lu, Xingyu; Doré, Louis C.; Weng, Xiaocheng; Ji, Quanjiang; Mets, Laurens; He, Chuan (May 2015). "N6-Methyldeoxyadenosine Marks Active Transcription Start Sites in Chlamydomonas". Cell. 161 (4): 879–892. doi:10.1016/j.cell.2015.04.010. PMC 4427561. PMID 25936837.
  26. ^ Vlcek D, Sevcovicová A, Sviezená B, Gálová E, Miadoková E. Chlamydomonas reinhardtii: a convenient model system for the study of DNA repair in photoautotrophic eukaryotes. Curr Genet. 2008 Jan;53(1):1-22. doi: 10.1007/s00294-007-0163-9. Epub 2007 Nov 9. PMID 17992532
  27. ^ Colegrave N (2002). "Sex releases the speed limit on evolution". Nature. 420 (6916): 664–666. Bibcode:2002Natur.420..664C. doi:10.1038/nature01191. hdl:1842/692. PMID 12478292. S2CID 4382757.
  28. ^ De Visser et al. 1996 The effect of sex and deleterious mutations on fitness in Chlamydomonas. Proc. R. Soc. Lond. B 263-193-200.
  29. ^ Collins , Bell (2004). "Phenotypic consequences of 1,000 generations of selection at elevated CO2 in a green alga". Nature. 431 (7008): 566–569. Bibcode:2004Natur.431..566C. doi:10.1038/nature02945. PMID 15457260. S2CID 4354542.
  30. ^ Kondrashov AS (October 1984). "Deleterious mutations as an evolutionary factor. 1. The advantage of recombination". Genet. Res. 44 (2): 199–217. doi:10.1017/s0016672300026392. PMID 6510714.
  31. ^ Renaut S, Replansky T, Heppleston A, Bell G (November 2006). "The ecology and genetics of fitness in Chlamydomonas. XIII. Fitness of long-term sexual and asexual populations in benign environments". Evolution. 60 (11): 2272–9. doi:10.1554/06-084.1. PMID 17236420. S2CID 18977144.
  32. ^ a b Polin, Marco; Tuval, Idan; Drescher, Knut; Gollub, J. P.; Goldstein, Raymond E. (2009-07-24). "Chlamydomonas Swims with Two "Gears" in a Eukaryotic Version of Run-and-Tumble Locomotion". Science. 325 (5939): 487–490. Bibcode:2009Sci...325..487P. doi:10.1126/science.1172667. ISSN 0036-8075. PMID 19628868. S2CID 10530835.
  33. ^ Garcia, Michaël (2013-07-09). Hydrodynamique de micro-nageurs (phdthesis thesis) (in French). Université de Grenoble.
  34. ^ Goldstein, Raymond E (2018-07-23). "Are theoretical results 'Results'?". eLife. 7: e40018. doi:10.7554/eLife.40018. ISSN 2050-084X. PMC 6056240. PMID 30033910.
  35. ^ Demurtas OC; Massa S; Ferrante P; Venuti A; Franconi R; et al. (2013). "A Chlamydomonas-Derived Human Papillomavirus 16 E7 Vaccine Induces Specific Tumor Protection". PLOS ONE. 8 (4): e61473. Bibcode:2013PLoSO...861473D. doi:10.1371/journal.pone.0061473. PMC 3634004. PMID 23626690.
  36. ^ (16 May 2012) Biologists produce potential malarial vaccine from algae PhysOrg, Retrieved 15 April 2013
  37. ^ (10 December 2012) Engineering algae to make complex anti-cancer 'designer' drug PhysOrg, Retrieved 15 April 2013
  38. ^ Darwish, Randa; Gedi, Mohamed; Akepach, Patchaniya; Assaye, Hirut; Zaky, Abderlahman; Gray, David (26 September 2020). "Chlamydomonas reinhardtii Is a Potential Food Supplement with the Capacity to Outperform Chlorella and Spirulina". Applied Sciences. 10 (19): 6736. doi:10.3390/app10196736. Retrieved 26 August 2021.
  39. ^ Anastasios Melis; Thomas Happe (2004). "Trails of green alga hydrogen research — from Hans Gaffron to new frontiers" (PDF). Photosynthesis Research. 80 (1–3): 401–409. doi:10.1023/B:PRES.0000030421.31730.cb. PMID 16328836. S2CID 7188276.
  40. ^ Laurent Cournac; Florence Musa; Laetitia Bernarda; Geneviève Guedeneya; Paulette Vignaisb; Gilles Peltie (2002). "Limiting steps of hydrogen production in Chlamydomonas reinhardtii and Synechocystis PCC 6803 as analysed by light-induced gas exchange transients". International Journal of Hydrogen Energy. 27 (11/12): 1229–1237. doi:10.1016/S0360-3199(02)00105-2.
  41. ^ Anastasios Melis. "Hydrogen and hydrocarbon biofuels production via microalgal photosynthesis". Archived from the original on 2008-04-03. Retrieved 2008-04-07.
  42. ^ Kosourov, S.; Tsyganov, A.; Seibert, M.; Ghirardi, M. (June 2002). "Sustained Hydrogen Photoproduction by Chlamydomonas reinhardtii:Effects of Culture Parameters". Biotechnol. Bioeng. 78 (7): 731–40. doi:10.1002/bit.10254. PMID 12001165.
  43. ^ Fernandez VM, Rua ML, Reyes P, Cammack R, Hatchikian EC (November 1989). "Inhibition of Desulfovibrio gigas hydrogenase with copper salts and other metal ions". Eur. J. Biochem. 185 (2): 449–54. doi:10.1111/j.1432-1033.1989.tb15135.x. PMID 2555191.
  44. ^ Kosourov, S.; Jokel, M.; Aro, E.-M.; Allahverdiyeva, Y. (March 2018). "A new approach for sustained and efficient H2 photoproduction by Chlamydomonas reinhardtii". Energy & Environmental Science. 11 (6): 1431–1436. doi:10.1039/C8EE00054A.
  45. ^ Nagy, V.; Podmaniczki, A.; Vidal-Meireles, A.; Tengölics, R.; Kovács, L.; Rákhely, G.; Scoma, A.; Tóth SZ. (March 2018). "Water-splitting-based, sustainable and efficient H2 production in green algae as achieved by substrate limitation of the Calvin–Benson–Bassham cycle". Biotechnology for Biofuels. 11: 69. doi:10.1186/s13068-018-1069-0. PMC 5858145. PMID 29560024.
licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Wikipedia authors and editors
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia EN

Chlamydomonas reinhardtii: Brief Summary ( anglais )

fourni par wikipedia EN

Chlamydomonas reinhardtii is a single-cell green alga about 10 micrometres in diameter that swims with two flagella. It has a cell wall made of hydroxyproline-rich glycoproteins, a large cup-shaped chloroplast, a large pyrenoid, and an eyespot that senses light.

Chlamydomonas species are widely distributed worldwide in soil and fresh water. Chlamydomonas reinhardtii is an especially well studied biological model organism, partly due to its ease of culturing and the ability to manipulate its genetics. When illuminated, C. reinhardtii can grow photoautotrophically, but it can also grow in the dark if supplied with organic carbon. Commercially, C. reinhardtii is of interest for producing biopharmaceuticals and biofuel, as well being a valuable research tool in making hydrogen.

licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Wikipedia authors and editors
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia EN

Chlamydomonas reinhardtii ( espéranto )

fourni par wikipedia EO
Chlamydomonas6-1.jpg

Chlamydomonas reinhardtii estas verdalga specio el genro Chlamydomonas.

Priskribo

Chlamydomonas reinhardtii estas 14 ĝis 22 mikrometrojn granda verdalgo kun preskaŭ kugla formo kaj kun du flageloj. La ĉelmembrano dikiĝis ĉe la antaŭa flanko, la unuĉelulo havas grandan okulmakulon. La kloroplasto havas grandan pirenoidon. La specio larĝe disvastiĝis kaj troviĝas ĉefe en etaj akvoj.

licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Vikipedio aŭtoroj kaj redaktantoj
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia EO

Chlamydomonas reinhardtii: Brief Summary ( espéranto )

fourni par wikipedia EO
Chlamydomonas6-1.jpg

Chlamydomonas reinhardtii estas verdalga specio el genro Chlamydomonas.

licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Vikipedio aŭtoroj kaj redaktantoj
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia EO

Chlamydomonas reinhardtii ( espagnol ; castillan )

fourni par wikipedia ES

La Chlamydomonas reinhardtii es un alga unicelular de 10 micrómetros de diámetro que nada con dos flagelos.
C. reinhardtii contiene un cloroplasto en forma de copa, que ocupa el 40% del volumen de toda la célula. Los depósitos de almidón típicamente rodean el pirenoide y también se acumulan entre las membranas de tilacoides. Las mitocondrias aparecen como orgánulos alargados que forman una red interconectada. El núcleo tiene 2-4 µm de diámetro. El aparato de Golgi se localiza en las cercanías del núcleo y el retículo ER. [1]

 src=
Ultraestructura. Vacuolas (Va), Núcleo (Nc,) Nucleolo (Ncl), Mitocondria (Mt), Cloroplasto (Cp), Pirenoide (Py), Tilacoides (Th), cuerpos lipídicos (Li).

En este género la célula vegetativa haplonte sufre cambios hasta funcionar como un gametangio. Se divide y se forman 4, 8, 16 a 32 gametos flagelados, que son liberadas al agua. Allí se unen dos gametos formando un huevo o cigoto. Este cigoto luego se divide meióticamente dando cuatro coosporas flageladas, las que aumentan de volumen dando cada una célula vegetativa.

Video de la reconstrucción 3D.

Es de la División de las clorofitas, flagelados en alguna fase, poseen clorofila a y c y carotenoides, sus reservas de energía es el almidón.

Referencias

  1. Hummel E, Guttmann P, Werner S, Tarek B, Schneider G, Kunz M, (2012). «3D Ultrastructural Organization of Whole Chlamydomonas reinhardtii Cells Studied by Nanoscale Soft X-Ray Tomography.». PLoS ONE 7 (12): e53293.

 title=
licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Autores y editores de Wikipedia
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia ES

Chlamydomonas reinhardtii: Brief Summary ( espagnol ; castillan )

fourni par wikipedia ES

La Chlamydomonas reinhardtii es un alga unicelular de 10 micrómetros de diámetro que nada con dos flagelos.
C. reinhardtii contiene un cloroplasto en forma de copa, que ocupa el 40% del volumen de toda la célula. Los depósitos de almidón típicamente rodean el pirenoide y también se acumulan entre las membranas de tilacoides. Las mitocondrias aparecen como orgánulos alargados que forman una red interconectada. El núcleo tiene 2-4 µm de diámetro. El aparato de Golgi se localiza en las cercanías del núcleo y el retículo ER. ​

 src= Ultraestructura. Vacuolas (Va), Núcleo (Nc,) Nucleolo (Ncl), Mitocondria (Mt), Cloroplasto (Cp), Pirenoide (Py), Tilacoides (Th), cuerpos lipídicos (Li).

En este género la célula vegetativa haplonte sufre cambios hasta funcionar como un gametangio. Se divide y se forman 4, 8, 16 a 32 gametos flagelados, que son liberadas al agua. Allí se unen dos gametos formando un huevo o cigoto. Este cigoto luego se divide meióticamente dando cuatro coosporas flageladas, las que aumentan de volumen dando cada una célula vegetativa.

Video de la reconstrucción 3D.

Es de la División de las clorofitas, flagelados en alguna fase, poseen clorofila a y c y carotenoides, sus reservas de energía es el almidón.

licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Autores y editores de Wikipedia
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia ES

Chlamydomonas reinhardtii

fourni par wikipedia FR

Chlamydomonas reinhardtii est une espèce d'algues vertes, utilisée comme modèle en biologie végétale. Ses caractéristiques génétiques, structurale (unicellulaire) et de croissance (culture sur boîte de Petri ou en milieu liquide) lui valent parfois le surnom de « levure verte », par analogie avec la levure Saccharomyces cerevisiae, organisme modèle des eucaryotes unicellulaires non photosynthétiques.

Modèle et génétique

Cette algue mobile a été utilisée comme modèle depuis les années 1960 pour, notamment, étudier le fonctionnement des flagelles végétaux, la photosynthèse et certaines particularités génomiques qu’elle partage avec des animaux. C'est chez cet organisme que la biogenèse des flagelles a été étudiée et que la présence d'ADN dans les chloroplastes a été découverte.
Le décryptage de son génome a commencé en 2001 et a été publié six ans plus tard par la revue Science (oct 2007). 120 millions de paires de bases forment environ 15 000 gènes. Ceux-ci comprennent un mélange de gènes animaux et végétaux : 35 % de ces gènes sont communs à cette espèce, aux plantes à fleurs et à l'humain, 10 % sont typiquement animaux, dont ceux codant des enzymes (nucléotides cyclases ou ceux synthétisant des sélénoprotéines chez certaines lignées animales dont des vertébrés)[2], ce qui est beaucoup pour une algue unicellulaire. Le décryptage complet a associé une centaine de chercheurs mobilisés par le Joint Genome Institute (JGI) du département américain de l'énergie (D0E). Olivier Vallon (CNRS) a coordonné l’annotation du génome (description fonctionnelle des gènes), ce qui pourrait être utile pour mieux comprendre son fonctionnement, ou l’exploiter pour le Génie génétique.

Les télomères sont en général constitués de répétitions d'une séquence TTTTAGGG. Ils sont précédés de sous-télomères (en), constitués (sur 31 des 34 extrémités de chromosomes) non pas de transposons mais de séquences répétitives spécifiques appelées « Sultan » (SUbtelomeric Long TANdem repeat), longues d'environ 850 nucléotides, se répétant de 2 à 46 fois par extrémité[3].

Physiologie

Comportement en carence en dioxyde de carbone

En 2012, l’équipe d’Olga Blifernez-Klassen[4], de l'université allemande de Bielefeld, en Rhénanie-du-Nord-Westphalie, a observé que placée dans un environnement extrême pauvre en dioxyde de carbone, élément nécessaire au processus de photosynthèse, la micro-algue verte sécrète une enzyme qui lui permet de digérer la cellulose des autres végétaux. La digestion a lieu en dehors de la cellule, et les sucres sont ensuite transportés dans la cellule. C'est la première fois qu'on observe chez un organisme chlorophyllien unicellulaire la capacité de produire de la matière organique par digestion, donc autrement que par photosynthèse.

Depuis, on sait que les microorganismes unicellulaires mixotrophes, comme mesodinium chamaeleon sont capables de digérer des microalgues vertes, ou de conserver en leur sein des microalgues rouges et leurs pigments photosynthetiques afin de se nourrir à la fois des nutriments digérés et de profiter de la photosynthese.

Reproduction

 src=
Représentation schématique d’une coupe longitudinale de Chlamydomonas reinhardtii.

Dans des conditions favorables, avec des nutriments comme de l’azote, Chlamydomonas reinhardtii croît et se multiplie de façon asexuée, qu'elle soit éclairée ou non. Mais lors d’une carence en azote, et avec de la lumière, elle se différencie en gamètes en se divisant de manière mitotique. La lumière semble agir de façon indirecte, par la photosynthèse pour avoir l’énergie de se différencier, et n’est pas nécessaire pour la fusion des gamètes par la suite. Cependant, l’ajout d’azote à des gamètes cause la dédifférenciation des gamètes en cellules végétatives. Les deux types de gamètes sont identiques en apparence, et sont appelés mt(+) et mt(-). Leur fusion forme un zygote diploïde stable non flagellé pouvant rester dormant en attendant des conditions plus favorables, ayant une taille cellulaire et nucléaire supérieure ainsi que plus d’ADN par noyau et un plus grand nombre de chromosomes. Il possède aussi une paroi plus épaisse. On parle de zygote mature. Lorsque le milieu est plus favorable au développement de l’algue, le zygote subit une méiose et relâche 4 ou 8 cellules haploïdes[5],[6].

Biotechnologies

Production de molécules anticancéreuses

En 2013, l'équipe du professeur Tran[7] à San Diego a réussi à transfecter des cellules de Chlamydomonas reinhardtii avec un vecteur contenant une immunotoxine anticancéreuse. Ce vecteur est composé de :

  • la partie variable (lourde et légère) d'un anticorps anti CD22 (antigène tumoral),
  • les domaines 2 et 3 de l'exotoxine A de P.aeruginosa (inhibiteur de traduction eucaryote par ribosylation du facteur d'élongation eEF2),
  • les domaines constants CH2,CH3 de l'immunoglobuline 1 (permettent d'augmenter l'efficacité par homodimérisation).

Cette immunotoxine se fixe spécifiquement sur les antigènes tumoraux CD22 et inhibe la prolifération des cellules cancéreuses par action des domaines de l'exotoxine.

Production de biocarburants

Chlamydomonas reinhardtii est un modèle émergent pour la production de biocarburants. En effet, son génome est modifiable facilement (miRNA, CrispR-Cas9, transfection) ce qui permet d'améliorer les souches de culture sur plusieurs aspects :

  • amélioration de la robustesse et de la croissance par augmentation de l'efficacité photosynthétique en modifiant le génome chloroplastique,
  • amélioration de la production de biodiesel (à partir de la transestérification des lipides) par augmentation du contenu en triacylglycérol dans un milieu carencé en azote,
  • amélioration de la production de dihydrogène en milieu carencé en soufre afin de diminuer l'inhibition de l'hydrogénase par l'oxygène.

Il est donc possible de modifier génétiquement les souches de Chlamydomonas reinhardtii et/ou de les produire dans divers milieux de culture en fonction de ce que l'on cherche à obtenir. [8]

Notes et références

  1. Guiry, M.D. & Guiry, G.M. AlgaeBase. World-wide electronic publication, National University of Ireland, Galway. https://www.algaebase.org, consulté le 5 mai 2013
  2. Revue Biofutur, déc 2007, p 13
  3. Oana Ilioaia, « Que trouve-t-on à l’extrémité d’un chromosome ? Le cas d'une petite algue verte », sur CNRS, 18 août 2021 (consulté le 29 août 2021).
  4. (en) Olga Blifernez-Klassen, Viktor Klassen, Anja Doebbe, Klaudia Kersting, Philipp Grimm, Lutz Wobbe et Olaf Kruse, « Cellulose degradation and assimilation by the unicellular phototrophic eukaryote Chlamydomonas reinhardtii », Nature Communications, vol. 3, no 1214,‎ 20 novembre 2012 (lire en ligne)
  5. (en) Ruth Sager et S.Granick, « Nutritional control of sexuality in Chlamydomonas reinhardi », Journal of General Physiology,‎ 5 janvier 1954 (lire en ligne)
  6. (en) Ebersold WT, « Chlamydomonas reinhardi: heterozygous diploid strains », Science,‎ 28 juillet 1967 (lire en ligne)
  7. (en) Miller Tran, Ryan E. Henry, David Siefker et Christina Van, « Production of anti-cancer immunotoxins in algae: Ribosome inactivating proteins as fusion partners », Biotechnology and Bioengineering, vol. 110, no 11,‎ 1er novembre 2013, p. 2826–2835 (ISSN , DOI , lire en ligne, consulté le 14 novembre 2017)
  8. (en) Melissa A. Scranton, Joseph T. Ostrand, Francis J. Fields et Stephen P. Mayfield, « Chlamydomonas as a model for biofuels and bio-products production », The Plant Journal, vol. 82, no 3,‎ 1er mai 2015, p. 523–531 (ISSN , DOI , lire en ligne, consulté le 14 novembre 2017)

licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Auteurs et éditeurs de Wikipedia
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia FR

Chlamydomonas reinhardtii: Brief Summary

fourni par wikipedia FR

Chlamydomonas reinhardtii est une espèce d'algues vertes, utilisée comme modèle en biologie végétale. Ses caractéristiques génétiques, structurale (unicellulaire) et de croissance (culture sur boîte de Petri ou en milieu liquide) lui valent parfois le surnom de « levure verte », par analogie avec la levure Saccharomyces cerevisiae, organisme modèle des eucaryotes unicellulaires non photosynthétiques.

licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Auteurs et éditeurs de Wikipedia
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia FR

Chlamydomonas reinhardtii ( galicien )

fourni par wikipedia gl Galician

Chlamydomonas reinhardtii é unha especie de alga verde unicelular de aproximadamente 10 micrómetros de diámetro que nada impulsándose con dous flaxelos e vive en augas doces e no solo. Ten unha parede celular feita de glicoproteínas ricas en hidroxiprolina, un cloroplasto grande con forma de copa, un grande pirenoide, e unha "mancha ocular" que percibe a luz.

Está amplamente distribuída por todo o mundo en augas doces e no solo, e utilízase principalmente como organismo modelo en estudos biolóxicos de diversos campos. Cando recibe luz, C. reinhardtii pode crecer en medios carentes de fontes de carbono orgánico e de enerxía química facendo a fotosíntese, pero pode tamén crecer na escuridade cando se lle subministran eses produtos. C. reinhardtii é tamén interesante para a produción de produtos biofarmacéuticos e de biocombustibles, xa que pode producir hidróxeno.

Historia

A C. reinhardtii de tipo salvaxe da cepa de laboratorio c137 (mt+) orixinouse a partir dun illado feito preto de Amherst, Massachusetts, en 1945 por Gilbert M. Smith.[1][2]

O nome da especie tense escrito de diferentes maneiras debido ás variadas transliteracións dun apelido ruso en cirílico: reinhardi, reinhardii, reinhardti e reinhardtii (este último é o nome científico actual: C. reindhardtii Dangeard).[3] A especie foi descrita por P. A. Dangeard en 1888, que lle puxo ese nome en honor ao botánico ucraíno Ludwig Reinhard(t), que describiu en 1876 o apareamento desta especie (á cal el lle dera outro nome).[4]

C. reinhardtii, igual que as outras algas verdes, era clasificada tradicionalmemte como protista. Nas clasificacións actuais as algas verdes tenden a clasificarse xunto coas plantas, con varios nomes, segundo os autores, para o taxon superior no que se inclúen (por exemplo Viridiplantae ou Plantae).

Organismo modelo

 src=
Sección da célula da alga Ch.reinhardtii.

Ch. reindhardtii utilízase como organismo modelo para investigar cuestións fundamentais da bioloxía da célula e bioloxía molecular como:

  • Como se moven as células.
  • Como responden á luz.
  • Como se recoñecen unhas a outras.
  • Como xeran as células as ondulacións falxelares regulares e repetibles.
  • Como regulan as células o seu proteoma para controlar a lonxitude do flaxelo.
  • Como responden as células aos cambios na súa nutrición en minerais (xofre, nitróxeno etc.).

Coñécense moitos mutantes de C. reinhardtii. Estes mutantes son ferramentas útiles para estudar diversos procesos biolóxicos, como a motilidade flaxelar, a fotosíntese, e a síntese de proteínas. Como esta especie, e outras especies de Chlamydomonas, son normalmente haploides, os efectos das mutacións poden verse inmediatamente sen ter que facer máis cruzamentos.

En 2007, publicouse a secuencia xenómica nuclear completa de C. reinhardtii.[5]

As proteínas canalrodopsina-1 e canalrodopsina-2, que funcionan como canais iónicos de apertura controlada pola luz, illáronse orixinalmente de C. reinhardtii.[6][7]

Reprodución

As células vexetativas de C. reinhardtii son haploides e teñen 17 pequenos cromosomas. Cando hai carencia de nitróxeno, as células vexetativas diferéncianse en gametos haploides.[8] As células pertencen a dous tipos de apareamento posibles, que son idénticos en aparencia, chamados mt(+) e mt(-), que se fusionan para formar un cigoto diploide. O cigoto non é flaxelado e funciona como unha forma dormente da especie no solo. En presenza de luz, o cigoto sofre meiose e orixina catro células haploides flaxeladas que reinician o ciclo de vida vexetativo.

En condicións de crecemento ideais, as células poden ás veces sufrir dúas ou tres mitoses antes de que as células fillas se liberen da vella parede celular. Así, nunha soa etapa de crecemento pode orixinar 4 ou 8 células fillas por cada célula nai.

O ciclo celular desta alga verde unicelular pode ser sincronizado alternando períodos de luz e escuridade. A fase de crecemento depende da luz, mentres que, despois dun punto chamado de transición ou de compromiso, os procesos son independentes da luz.[9]

Xenética

O atractivo que ten esta alga como organismo modelo incrementouse recentemente coa publicación de varios recursos xenómicos que pasaron a dominio público. O borrador Chlre3 da secuencia xenómica nuclear desta especie preparado polo Joint Genome Institute do Departamento de Enerxía dos EUA comprende 1557 armazóns cun total de 120 Mb. Aproximadamente a metade do xenoma está contido en 24 armazóns de polo menos 1,6 Mb de lonxitude cada un. A ensamblaxe actual do xenoma nuclear está dispoñible en liña.[10]

O xenoma mitocondrial (acceso á base de datos: NC_ 001638) está tamén dispoñible en liña na base de datos do NCBI.[11] O xenoma cloroplástico completo de>200 kb está igualmente dispoñible en liña.[12]

Ademais dos datos da secuencia xenómica, hai unha grande cantidade de datos de secuencias de expresión dispoñibles como librarías de ADNc e marcadores de secuencias expresadas (ESTs). En liña están dispoñibles sete destas librarías de ADNc.[13] A libraría BAC pode mercarse no Clemson University Genomics Institute.[14] Hai tamén dúas bases de datos en liña de>50.000 [15] e>160.000 ESTs.[16]

Evolución

Chlamydomonas foi utilizada para estudar diferentes aspectos da bioloxía evolutiva e ecoloxía. É un organismo de elección para moitos experimentos de selección porque (1) ten un curto tempo de xeración, (2) funciona tanto como organismo heterótrofo coma de forma autótrofa facultativa, (3) pode reproducirse tanto sexualmente coma asexualmente, e (4) hai unha ampla información xenética dispoñible sobre ela.

Algúns exemplos (non exhaustivos) dos traballos evolutivos realizados con Chlamydomonas son a evolución da reprodución sexual,[17] o efecto na eficacia biolóxica ou fitness das mutacións,[18] e o efecto da adaptación a distintos niveis de CO2.[19]

Segundo unha hipótese frecuentemente citada,[20] a reprodución sexual (a diferenza da asexual) é mantida adaptativamente en ambientes favorables porque reduce a carga mutacional ao combinar mutacións deletéreas de diferentes liñas de descendencia e incrementa a fitness media. Porén, nun estudo experimental a longo prazo con C. reinhardtii, as probas obtidas contradín esa hipótese. Nas poboacións sexuais, non se atopou que houbese eliminación de mutacións e non se viu que se incrementase a fitness.[21]

Técnicas de transformación do ADN

A transformación xénica ocorre principalmente por recombinación homóloga nos cloroplastos e recombinación heteróloga no núcleo. O xenoma cloroplástico de C. reinhardtii pode ser transformado realizando un bombrdeo con partículas microproxectís ou por axitación con esferiñas de cristal, aínda que este último método é menos eficaz. O xenoma nuclear foi transformado con axitación con esferiñas de cristal e por electroporacón. O procedemento de bombardeo de partículas parece ser o método máis eficaz para introducir ADN no xenoma do cloroplasto. Isto débese probablemente a que o cloroplasto ocupa case a metade do volume da célula, o que fai que sexa unha grande diana para os microproxectís. A electroporación é a forma máis eficaz para introducir ADN no xenoma nuclear cunhas frecuencias de transformación máximas de dúas ordes de magnitude maiores que as obtidas usando o método da axitación con esferiñas de cristal.

Produción de produtos biofarmacéuticos

Utilizáronse células de Ch. reinhardtii transformadas por enxeñaría xenética para producir diversos compostos útiles, como unha proteína amiloide sérica de mamífero, e tamén un anticorpo humano, o factor de crecemento vascular humano, unha potencial vacina terapéutica do Papillomavirus humano 16,[22] unha potencial vacina da malaria,[23] e un fármaco de complexo deseño que podería utilizarse na loita contra o cancro.[24]

Fonte limpa para a produción de hidróxeno

En 1939, o investigador alemán Hans Gaffron (1902–1979), que daquela traballaba na Universidade de Chicago, descubriu o metabolismo do hidróxeno das algas verdes unicelulares. Ch. reinhardtii e algunhas outras algas verdes poden, baixo espeiciais circunstancias, deixar de producir oxíxeno na fotosíntese e empezar a producir hidróxeno. Esta reacción feita pola hidroxenase, un encima que está activo só en ausencia de oxíxeno, ten curta duración. Nos seguintes trinta anos, Gaffron e o seu equipo descubriron a mecánica básica da produción fotosintética de hidróxeno feita polas algas.[25]

Para incrementar a produción de hidróxeno, os investigadores seguiron varios camiños:

  • O primeiro camiño foi desacoplar a hidroxenase da fotosíntese. Deste xeito, a acumulación de oxíxeno xa non pode inhibir a produción de hidróxeno. E, se se vai un paso alén e se cambia a estrutura do encima hidroxenase, faise posible facer a hidroxenase insensible ao oxíxeno. Isto fai posible unha produción continua de hidróxeno. Nese caso, o fluxo de electróns necesario para a produción xa non procede da produción de azucres fotosintética senón que deriva da degradación das propias reservas acumuladas de amidón.[26]
  • Unha segunda vía de investigación é interromper temporalmente o proceso da fotosíntese, por medio da manipulación xenética da hidroxenase. Isto impide que o oxíxeno chegue a un nivel no que podería causar a detención da produción de hidróxeno.[27]
  • O terceiro camiño seguido, principalmente na década de 1950, son os métodos mecánicos ou químicos de eliminación do O2 producido pola actividade fotosintética das células das algas. Entre estes están a adición de eliminadores de O2, a adición de redutores, e a purga dos cultivos con gases inertes.[28] Con todo, estes métodos non son escalables, e non poden utilizarse en sistemas aplicados. Apareceron novas liñas de investigación sobre a eliminación do oxíxeno en cultivos de algas, que poden eliminar os problemas de escalabilidade.
  • Unha cuarta liña de investigación usa sales de cobre para desacoplar a acción da hidroxenase da produción de oxíxeno.[29]

Notas

  1. "CC-125 wild type mt+ 137c". Chlamydomonas Center core collection list. Arquivado dende o orixinal o 27 de xullo de 2009. Consultado o 26 de decembro de 2014.
  2. The Chlamydomonas Sourcebook, ISBN 978-0-12-370873-1)
  3. http://megasun.bch.umontreal.ca/protists/chlamy/taxonomy.html Chlamydomonas Taxonomy.
  4. Elizabeth H. Harris. The Chlamydomonas Sourcebook: A Comprehensive Guide to Biology and Laboratory Use. Páxina 16. Google books. [1]
  5. Merchant; Prochnik, SE; Vallon, O; Harris, EH; Karpowicz, SJ; Witman, GB; Terry, A; Salamov, A; et al. (2007). "The Chlamydomonas Genome Reveals the Evolution of Key Animal and Plant Functions". Science 318 (5848): 245–250. PMC 2875087. PMID 17932292. doi:10.1126/science.1143609.
  6. Nagel G, Ollig D, Fuhrmann M; et al. (June 28, 2002). "Channelrhodopsin-1: a light-gated proton channel in green algae". S cience 296 (5577): 2395–8. PMID 12089443. doi:10.1126/science.1072068.
  7. Lagali PS, Balya D, Awatramani GB, Münch TA, Kim DS, Busskamp V, Cepko CL, Roska B (June 2008). "Light-activated channels targeted to ON bipolar cells restore visual function in retinal degeneration". Nature Neuroscience 11 (6): 667–75. PMID 18432197. doi:10.1038/nn.2117.
  8. SAGER R, GRANICK S (July 1954). "Nutritional control of sexuality in Chlamydomonas reinhardi". J. Gen. Physiol. 37 (6): 729–42. PMC 2147466. PMID 13174779. doi:10.1085/jgp.37.6.729.
  9. Oldenhof H, Zachleder V., den Ende H. (2006). "Blue- and red-light regulation of the cell cycle in Chlamydomonas reinhardtii (Chlorophyta)". Eur. J. Phycol 41: 313–320. doi:10.1080/09670260600699920.
  10. http://genome.jgi-psf.org/Chlre3/Chlre3.home.html
  11. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
  12. http://www.chlamy.org/chloro/default.html
  13. "Copia arquivada". Arquivado dende o orixinal o 19 de outubro de 2004. Consultado o 26 de decembro de 2014.
  14. "Copia arquivada". Arquivado dende o orixinal o 26 de decembro de 2014. Consultado o 26 de decembro de 2014.
  15. http://www.kazusa.or.jp/en/plant/chlamy/EST/
  16. "Copia arquivada". Arquivado dende o orixinal o 04 de febreiro de 2005. Consultado o 26 de decembro de 2014.
  17. Colegrave N (2002). "Sex releases the speed limit on evolution". Nature 420 (6916): 664–666. PMID 12478292. doi:10.1038/nature01191.
  18. De Visser et al. 1996 The effect of sex and deleterious mutations on fitness in Chlamydomonas. Proc. R. Soc. Lond. B 263-193-200.
  19. Collins , Bell (2004). "Phenotypic consequences of 1,000 generations of selection at elevated CO2 in a green alga". Nature 431: 566–569. doi:10.1038/nature02945.
  20. Kondrashov AS (October 1984). "Deleterious mutations as an evolutionary factor. 1. The advantage of recombination". Genet. Res. 44 (2): 199–217. PMID 6510714. doi:10.1017/s0016672300026392.
  21. Renaut S, Replansky T, Heppleston A, Bell G (November 2006). "The ecology and genetics of fitness in Chlamydomonas. XIII. Fitness of long-term sexual and asexual populations in benign environments". Evolution 60 (11): 2272–9. PMID 17236420. doi:10.1554/06-084.1.
  22. Demurtas OC, Massa S, Ferrante P, Venuti A, Franconi R, et al. (2013) A Chlamydomonas-Derived Human Papillomavirus 16 E7 Vaccine Induces SpecificTumor Protection. PLoS ONE 8(4): e61473. doi 10.1371/journal.pone.0061473
  23. (16 Maio 2012) Biologists produce potential malarial vaccine from algae PhysOrg, Retrieved 15 April 2013
  24. (10 de decembro de 2012) Engineering algae to make complex anti-cancer 'designer' drug PhysOrg, Retrieved 15 April 2013
  25. Anastasios Melis, Thomas Happe (2004). "Trails of green alga hydrogen research — from Hans Gaffron to new frontiers" (PDF). Photosynthesis Research 80 (1–3): 401–409. PMID 16328836. doi:10.1023/B:PRES.0000030421.31730.cb.
  26. Laurent Cournac, Florence Musa, Laetitia Bernarda, Geneviève Guedeneya, Paulette Vignaisb and Gilles Peltie (2002). "Limiting steps of hydrogen production in Chlamydomonas reinhardtii and Synechocystis PCC 6803 as analysed by light-induced gas exchange transients". International Journal of Hydrogen Energy 27 (11/12): 1229–1237. doi:10.1016/S0360-3199(02)00105-2.
  27. Anastasios Melis. "Hydrogen and hydrocarbon biofuels production via microalgal photosynthesis". Arquivado dende o orixinal o 03 de abril de 2008. Consultado o 2008-04-07.
  28. Kosourov, S. Tsyganov, A. Seibert, Ghirardi, M (June 2002). "Sustained Hydrogen Photoproduction by Chlamydomonas reinhardtii:Effects of Culture Parameters". Biotechnol. Bioeng. 78 (7): 731–40. PMID 12001165. doi:10.1002/bit.10254.
  29. Fernandez VM, Rua ML, Reyes P, Cammack R, Hatchikian EC. (November 1989). "Inhibition of Desulfovibrio gigas hydrogenase with copper salts and other metal ions". Eur. J. Biochem. 185 (2): 449–54. PMID 2555191. doi:10.1111/j.1432-1033.1989.tb15135.x.

Véxase tamén

Bibliografía

  • Aoyama, H., Kuroiwa, T. and Nakamura, S. 2009. The dynamic behaviour of mitochondria in living zygotes during maturation and meiosis in Chlamydomonas reinhardtii. Eur. J. Phycol. 44: 497 - 507.
  • Jamers, A., Lenjou, M., Deraedt, P., van Bockstaele, D., Blust, R. and de Coen, W. 2009. Flow cytometric analysis of the cadmium-exposed green algae Chlamydomonas reinhadtii (Chlorophyceae). Eur. J. Phcol. 44: 54 - 550.

licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Autores e editores de Wikipedia
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia gl Galician

Chlamydomonas reinhardtii: Brief Summary ( galicien )

fourni par wikipedia gl Galician

Chlamydomonas reinhardtii é unha especie de alga verde unicelular de aproximadamente 10 micrómetros de diámetro que nada impulsándose con dous flaxelos e vive en augas doces e no solo. Ten unha parede celular feita de glicoproteínas ricas en hidroxiprolina, un cloroplasto grande con forma de copa, un grande pirenoide, e unha "mancha ocular" que percibe a luz.

Está amplamente distribuída por todo o mundo en augas doces e no solo, e utilízase principalmente como organismo modelo en estudos biolóxicos de diversos campos. Cando recibe luz, C. reinhardtii pode crecer en medios carentes de fontes de carbono orgánico e de enerxía química facendo a fotosíntese, pero pode tamén crecer na escuridade cando se lle subministran eses produtos. C. reinhardtii é tamén interesante para a produción de produtos biofarmacéuticos e de biocombustibles, xa que pode producir hidróxeno.

licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Autores e editores de Wikipedia
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia gl Galician

Chlamydomonas reinhardtii ( italien )

fourni par wikipedia IT

Chlamydomonas reinhardtii è un'alga eucariote unicellulare, di circa 10 µm di diametro, che si muove servendosi di due flagelli (lunghi circa 10 µm). Va precisato che non ha nulla a che fare con il batterio Chlamydia trachomatis, responsabile della nota malattia venerea.

Caratteristiche e ciclo vitale

C.reinhardtii è molto presente nel suolo e nei bacini di acqua dolce. Presenta una parete cellulare, un ampio cloroplasto ed un apparato sensibile alla luce, detto eyespot[1]. In genere le varie specie di Chlamydomonas possono essere coltivate in un terreno minimo (con sali inorganici) in presenza di luce (per avviare la fotosintesi). Se somministrato acido acetico, possono crescere anche al buio.

C.reinhardtii è presente per la maggior parte sotto forma di cellule vegetative flagellate, aploidi, con 17 piccoli cromosomi (per un genoma di circa 100 milioni di paia di basi). Se le cellule perdono la fonte di azoto, si formano gameti aploidi. Ci sono due tipi sessuali, identici all'osservazione, chiamati mt(+) e mt(-), che possono fondere e formare uno zigote diploide. Lo zigote non è flagellato, ma rimane dormiente nel suolo: se esposto alla luce, può andare incontro alla meiosi, rilasciando quattro cellule aploidi flagellate, che riprendono la fase vegetativa.

C.reinhardtii è spesso chiamato lievito verde, dal momento che è fotosintetico (e quindi autotrofo), ma presenta caratteristiche molto simili a quelli dei lieviti (come Saccharomyces cerevisiae). Forma agevolmente colonie su piastra, presenta due tipi sessuali (può crescere sia in forma aploide che diploide), permette l'analisi delle tetradi (scoperte proprio in Chlamydomonas) durante la riproduzione e ha una crescita molto rapida (una generazione dura circa 5 ore). In condizioni di crescita ottimali, la cellula può andare incontro anche a due o tre mitosi prima che le cellule figlie vengano rilasciate all'esterno della parete della cellula madre. All'analisi dell'osservatore, così, da un singolo evento riproduttivo sembrano essere prodotte 4-8 cellule figlie.

C.reinhardtii come organismo modello

La linea cellulare considerata wild-type per l'organismo è chiamata c137 ed è di tipo sessuale mt+. La sua origine non è certa, ma si crede che sia stata raccolta in un campo nel New England negli anni quaranta. Sono noti molti mutanti di C. reinhardtii. I mutanti sono uno strumento utile per studiare un gran numero di processi biologici, come:

  • il movimento attraverso flagelli e la regolazione della loro lunghezza;
  • la risposta della cellula agli stimoli luminosi;
  • i meccanismi di riconoscimento tra due o più cellule;
  • la regolazione dell'espressione genica;
  • la formazione e l'eredità del cloroplasto;
  • la risposta alle variazioni di concentrazione dei sali inorganici presenti;
  • qualsiasi processo produttivo.

Per questi motivi, C.reinhardtii è un organismo modello che sta raccogliendo sempre più successo nella comunità scientifica: questa alga è diventato infatti un piccolo caso scientifico, con oltre 100 grandi laboratori nel mondo che hanno iniziato ad usarlo nel giro di pochi anni. La sua attrattiva è aumentata ulteriormente in seguito alla pubblicazione di dati riguardanti il suo genoma. Una prima parte di esso, infatti, è stato diffuso nel febbraio 2003 dal Joint Genome Institute del Dipartimento dell'Energia americano. Sono disponibili le sequenze del genoma nucleare dell'organismo, quasi interamente completato, e quelle dei suoi mitocondri (~15.8 Kb) e dei cloroplasti (~200 Kb). È inoltre disponibile un grande numero di cDNA di sequenze espresse e di ESTs.

Negli studi di microfluidità, C.reinhardtii è l'archetipo del nuotatore "puller", ossia di quel tipo di microorganismi che, per nuotare, tirano il fluido verso di sé.[2]

Trasformazione di C. reinhardtii

C. reinhardtii è un organismo molto maneggevole in laboratorio: ciò rende possibili numerose applicazioni biotecnologiche. È infatti un organismo molto semplice da trasformare: la trasformazione può avvenire attraverso ricombinazione omologa nel cloroplasto e non omologa nel nucleo. Il DNA nucleare viene comunemente trasformato attraverso elettroporazione. Il genoma del cloroplasto può essere trasformato, invece, attraverso un approccio biobalistico, sparando microproiettili di DNA nell'organello. Tali procedure rappresentano infatti la via più efficiente di trasformazione del cloroplasto. Ciò è probabilmente dovuto al fatto che il cloroplasto occupa più della metà del volume della cellula, fornendo così al proiettile un bersaglio molto ampio.

C. reinhardtii come fonte pulita di idrogeno

Grazie anche alle sue caratteristiche di organismo modello per la genetica, numerosi sono i campi di ricerca che utilizzano questo microrganismo al fine di comprendere diversi processi biologici. Uno dei più promettenti è quello legato alla produzione di idrogeno, che prevede minime quantità di gas serra quali l'anidride carbonica. Infatti, qualora fosse possibile utilizzare la microalga per la produzione di grandi quantità di idrogeno a fini energetici tale sintesi richiederebbe sostanzialmente le due risorse energetiche primarie sulla terra: l'acqua e la luce.

Già nel 1939 il ricercatore tedesco Hans Gaffron (1902-1979), allora alla University of Chicago, descrisse il metabolismo dell'idrogeno nelle alghe verdi unicellulari, scoprendo in quel caso la capacità da parte delle cellule di consumare l'idrogeno. Più tardi (1942), lo stesso Gaffron scoprì che interrompendo la produzione fotosintetica di ossigeno temporaneamente, le alghe verdi erano in grado di attivare la produzione di idrogeno per un breve periodo prima che la produzione di ossigeno si ristabilisse. Tale reazione, catalizzata da una ferro-idrogenasi, avviene esclusivamente in anaerobiosi, condizione assolutamente necessaria in quanto l'enzima è estremamente sensibile all'ossigeno. Questo elemento, infatti, è in grado di inibirne sia il sito attivo dell'enzima che la sua espressione genica. Dal punto di vista biologico, la produzione di idrogeno sembra essere essenzialmente una valvola di sfogo per la cellula che, in assenza di ossigeno, si trova ad avere un eccessivo numero di elettroni presso i cloroplasti, scartandoli anche attraverso l'attività della idrogenasi. Questo permette alla cellula di preservare la funzionalità del "motore" fotosintetico, salvandolo da un eccesso di potere riducente, e sintetizzando al contempo ATP, la principale fonte di energia utilizzata a livello cellulare.

Nei trent'anni successivi alla scoperta, molti ricercatori hanno cercato di chiarire ulteriormente i meccanismi che regolano la produzione di idrogeno da parte delle alghe. Negli ultimi anni, in particolare, il rinnovato interesse per le fonti energetiche rinnovabili ha dato ulteriore impulso alla ricerca in questo ambito, portando alla messa a punto di un primo metodo per rendere efficiente la produzione di idrogeno in C. reinhardtii. La metodica, descritta nel 2000 da Anastasios Melis dell'Università di Berkeley (California, USA), consiste nel privare il mezzo di coltura dello zolfo, un elemento fondamentale per il fotosistema II responsabile della fotolisi dell'acqua. Questa deprivazione porta, nel giro di circa 24 ore, ad una riduzione drastica della fotosintesi e, quindi, della produzione di ossigeno, fino a raggiungere le condizioni di anaerobiosi necessarie per attivare la produzione di idrogeno.[3]. In queste condizioni, la coltura algale si trova in anaerobiosi alla luce, una situazione che permette non solo la sintesi dell'idrogenasi, ma anche un flusso costante di elettroni all'enzima stesso dovuto alla luce, che viene raccolta dai pigmenti che normalmente garantiscono la fotosintesi.

In ogni caso, la durata della sintesi di idrogeno resta un fattore limitante per eventuali produzioni su larga scala a partire dal microorganismo. Il principale motivo di tale brevità è legato al fatto che nel caso della deprivazione di zolfo, la produzione di idrogeno dura al massimo una settimana, portando infine alla morte cellulare. Nel caso si utilizzi un mezzo di coltura completo, ovvero nelle condizioni in cui Gaffron e Rubin per primi osservarono questo fenomeno (1942), la produzione può durare da qualche minuto ad un'ora circa, dopo i quali la cellula è in grado di ripristinare la fotosintesi (e dunque la produzione di ossigeno).

Per risolvere la questione, attualmente si stanno seguendo diverse strategie, fra le quali:

  • la resistenza dell'idrogenasi all'ossigeno. In tal modo, l'accumulo di ossigeno non comprometterebbe più la funzionalità dell'enzima. Ciò renderebbe possibile una continua produzione di idrogeno sfruttando pienamente la fotosintesi[4].
  • la riduzione della competitività con altri enzimi. Sebbene un enzima insensibile all'ossigeno possa garantire l'utilizzo di una piena fotosintesi, determinando un aumento della produttività rispetto ai tassi attuali, questa soluzione non risolverebbe la competitività dell'idrogenasi con gli altri enzimi che normalmente ricevono gli elettroni della fotosintesi, quali ad esempio la Rubisco, responsabile del ciclo di Calvin, la quale agisce come principale accettore di elettroni rispetto all'idrogenasi. Questa soluzione, infatti, dovrebbe essere condotta in parallelo ad una serie di modifiche di tipo genetico o fisiologico in grado di ridurre il rifornimento di elettroni alle altre vie metaboliche, garantendo infine un rifornimento maggiore alla sola idrogenasi.
  • la sospensione temporanea, attraverso manipolazione genetica della idrogenasi, di vie metaboliche specifiche. Tale approccio intende rendere possibile, con una stessa coltura algale, accendere e spegnere l'espressione di determinati geni funzionali al processo, alternando fasi di aerobiosi e di anaerobiosi, ritardando sensibilmente il momento della morte cellulare e del ricambio della coltura. Nel caso della fotosintesi, ciò impedirebbe all'ossigeno di raggiungere un livello tale da inibire la produzione di idrogeno.[5]. Nel caso dell'idrogenasi, la soppressione mirata della sua espressione permetterebbe alla coltura di tornare ad un processo di crescita fisiologico in modo da ristabilire delle condizioni di salute ottimali in vista di una nuova fase di stress durante la quale evolvere nuovamente idrogeno. Recentemente, un sistema inducibile dell'espressione genica di Chlamydomonas è stato pubblicato[6] e brevettato da un gruppo di ricerca italiano dell'ENEA di Roma.

Con ogni probabilità, nessuno di questi approcci riuscirà individualmente a risolvere il problema dell'aumento di produttività di idrogeno in C. reinhardtii, mentre una integrazione funzionale fra loro potrebbe portare ad un significativo miglioramento dei risultati attuali. In questo senso, la produzione industriale di idrogeno per via biofotolitica a partire da microalghe non pare essere nel prossimo futuro. In teoria, la massima efficienza di conversione energetica della luce in prodotti del metabolismo in organismi fotosintetici è del 10% considerando la completa radiazione luminosa (20% se si considera solo lo spettro della luce visibile). I migliori risultati prodotti in laboratorio, dunque con luce artificiale, sono di poco superiori al 3%, e sono stati recentemente pubblicati da un gruppo italiano del CNR di Firenze. Ad ogni modo, la prima produzione di idrogeno con alghe verdi condotta con luce solare, pubblicata dallo stesso gruppo, a parte dimostrare la possibilità di condurre questo processo con luce solare, ha anche riportato una notevole riduzione della produttività. A questo proposito, lo studio di fotobioreattori efficienti ed a basso costo, dedicati specificamente a questo processo, è un elemento essenziale per la futuribilità e la riproduzione industriale di questa biotecnologia.

Note

  1. ^ (EN) Mark D. Thompson, Telsa M. Mittelmeier e Carol L. Dieckmann, Chlamydomonas: Molecular Genetics and Physiology, in Microbiology Monographs, Springer International Publishing, 2017, pp. 257–281, DOI:10.1007/978-3-319-66365-4_9, ISBN 9783319663654. URL consultato il 12 luglio 2019.
  2. ^ (EN) David Saintillan, Rheology of Active Fluids, in Annual Review of Fluid Mechanics, vol. 50, n. 1, 5 gennaio 2018, pp. 563–592, DOI:10.1146/annurev-fluid-010816-060049. URL consultato il 9 luglio 2021.
  3. ^ Anastasios Melis, Thomas Happe, Trails of green alga hydrogen research - from Hans gaffron to new frontiers (PDF), in Photosynthesis Research, vol. 80, 2004, pp. 401–409, DOI:10.1023/B:PRES.0000030421.31730.cb.
  4. ^ Laurent Cournac, Florence Musa, Laetitia Bernarda, Geneviève Guedeneya, Paulette Vignaisb and Gilles Peltie, Limiting steps of hydrogen production in Chlamydomonas reinhardtii and Synechocystis PCC 6803 as analysed by light-induced gas exchange transients, in International Journal of Hydrogen Energy, vol. 27, n. 11/12, 2002, pp. 1229–1237, DOI:10.1016/S0360-3199(02)00105-2.
  5. ^ Anastasios Melis, Hydrogen and hydrocarbon biofuels production via microalgal photosynthesis, su epmb.berkeley.edu. URL consultato il 7 aprile 2008 (archiviato dall'url originale il 3 aprile 2008).
  6. ^ (EN) Paola Ferrante, Claudia Catalanotti, Giulia Bonente, Giovanni Giuliano, An Optimized, Chemically Regulated Gene Expression System for Chlamydomonas, su dx.plos.org. URL consultato il 17 maggio 2021 (archiviato dall'url originale il 7 febbraio 2020).

 title=
licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Autori e redattori di Wikipedia
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia IT

Chlamydomonas reinhardtii: Brief Summary ( italien )

fourni par wikipedia IT

Chlamydomonas reinhardtii è un'alga eucariote unicellulare, di circa 10 µm di diametro, che si muove servendosi di due flagelli (lunghi circa 10 µm). Va precisato che non ha nulla a che fare con il batterio Chlamydia trachomatis, responsabile della nota malattia venerea.

licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Autori e redattori di Wikipedia
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia IT

Chlamydomonas reinhardtii ( latin )

fourni par wikipedia LA

Chlamydomonas reinhardtii (binomen a Dangeard anno 1888 statutum) est unicellularis alga viridis circa 10 µm lata qui duabus flagellis natat. Ei sunt murum cellulare glycoproteinis hydroxyprolino abundantibus factum, magnus chloroplastus cupulatus, magnum pyrenoidum, et locus oculatus (Anglice: eyespot) qui lucem sentit.

Bibliographia

  • Dangeard, P.-A. (1888). "Recherches sur les algues inférieures". Annales des Sciences Naturelles, Botanique, série 7 7: 105-175

Nexus externi

Wikidata-logo.svg Situs scientifici:ITISNCBIBiodiversityEncyclopedia of LifeWoRMS: Marine SpeciesINPN France stipula Haec stipula ad biologiam spectat. Amplifica, si potes!
licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Et auctores varius id editors
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia LA

Chlamydomonas reinhardtii: Brief Summary ( latin )

fourni par wikipedia LA

Chlamydomonas reinhardtii (binomen a Dangeard anno 1888 statutum) est unicellularis alga viridis circa 10 µm lata qui duabus flagellis natat. Ei sunt murum cellulare glycoproteinis hydroxyprolino abundantibus factum, magnus chloroplastus cupulatus, magnum pyrenoidum, et locus oculatus (Anglice: eyespot) qui lucem sentit.

licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Et auctores varius id editors
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia LA

Chlamydomonas reinhardtii ( norvégien )

fourni par wikipedia NN

Chlamydomonas reinhardtii er ein einsella grønalge som lever i jord og vasshaldige miljø. Han føretrekkjer temperaturar mellom 20 og 32 grader celsius.[1]

C. reinhardtii har vore nytta i mange tiår som ein modellorganisme for sellebiologi, særskilt for samansetjinga av flagellar og fotosyntese.[2] Ei skisse av genomet til organismen på kring 120 megabasar vart publisert i 2007.[3]

Kjelder

  1. Xie, Bo; Bishop, Shawn; Stessman, Dan; Wright, David; Spalding, Martin H; Halverson, Larry J (2013). «Chlamydomonas reinhardtii thermal tolerance enhancement mediated by a mutualistic interaction with vitamin B12-producing bacteria». The ISME Journal 7 (8): 1544. PMID 23486253. doi:10.1038/ismej.2013.43.
  2. Schroda, Michael (desember 2004). «The Chlamydomonas genome reveals its secrets: Chaperone genes and the potential roles of their gene products in the chloroplast». Photosynthesis Research 82 (3): 221–40. PMID 16143837. doi:10.1007/s11120-004-2216-y.
  3. Merchant, S. S.; Prochnik, S. E.; Vallon, O.; Harris, E. H.; et al. (12. oktober 2007). «The Chlamydomonas Genome Reveals the Evolution of Key Animal and Plant Functions». Science 318 (5848): 245. PMID 17932292. doi:10.1126/science.1143609.
Spire Denne biologiartikkelen er ei spire. Du kan hjelpe Nynorsk Wikipedia gjennom å utvide han.
licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Wikipedia authors and editors
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia NN

Chlamydomonas reinhardtii: Brief Summary ( norvégien )

fourni par wikipedia NN

Chlamydomonas reinhardtii er ein einsella grønalge som lever i jord og vasshaldige miljø. Han føretrekkjer temperaturar mellom 20 og 32 grader celsius.

C. reinhardtii har vore nytta i mange tiår som ein modellorganisme for sellebiologi, særskilt for samansetjinga av flagellar og fotosyntese. Ei skisse av genomet til organismen på kring 120 megabasar vart publisert i 2007.

licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Wikipedia authors and editors
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia NN

Chlamydomonas reinhardtii ( polonais )

fourni par wikipedia POL

Chlamydomonas reinhardtii – jednokomórkowa zielenica o średnicy 10 μm, pływająca przy pomocy dwóch wici.

Występowanie i budowa podobna do innych zielenic rodzaju zawłotnia (Chlamydomonas). Występuje w pospolicie wodach słodkich, wilgotnych glebach.

Szczep c137 (mt+) wyizolowany w 1945 r. w pobliżu Amherst, Massachusetts, USA jest jednym z modelowych organizmów badań biologicznych.

Chlamydomonas reinhardtii posiada jeden chloroplast. Energię w świetle zdobywa poprzez fotosyntezę. W ciemności wykorzystuje octan jako źródło energii i węgla.

W nietypowym środowisku, gdy jest mało siarki i tlenu, a dużo miedzi, jej chloroplast może przełączyć szlak fotofosforylacji i wytwarzać wodór. Prowadzone są prace nad selekcją warunków i modyfikacją genetyczną by zwiększyć wytwarzanie wodoru w celu przemysłowej produkcji biowodoru. Glony są obiecującymi organizmami do produkcji 3 generacji biopaliw jednak bezpośrednia produkcja wodoru przez biofotolizę[1] jest ciekawym rozwiązaniem bowiem pozwala omijać problemy z dokarmianiem CO2 glonów w fotoreaktorze.

Genetyka

W C. reinhardtii cyklu rozwojowym dominuje stadium haplofitowe. Jądrowy genom zawiera 1.6 Mb DNA w 17 chromosomach. 1.2 Mb sekwencja genomu została opublikowana w 2007 r.[2][3]

W plastydzie zawiera 203395 bp chlDNA[4].

Przypisy

  1. http://www.life.uiuc.edu/govindjee/Part3/33_Melis.pdf
  2. Merchant SS., Prochnik SE., Vallon O., Harris EH., Karpowicz SJ., Witman GB., Terry A., Salamov A., Fritz-Laylin LK., Maréchal-Drouard L., Marshall WF., Qu LH., Nelson DR., Sanderfoot AA., Spalding MH., Kapitonov VV., Ren Q., Ferris P., Lindquist E., Shapiro H., Lucas SM., Grimwood J., Schmutz J., Cardol P., Cerutti H., Chanfreau G., Chen CL., Cognat V., Croft MT., Dent R., Dutcher S., Fernández E., Fukuzawa H., González-Ballester D., González-Halphen D., Hallmann A., Hanikenne M., Hippler M., Inwood W., Jabbari K., Kalanon M., Kuras R., Lefebvre PA., Lemaire SD., Lobanov AV., Lohr M., Manuell A., Meier I., Mets L., Mittag M., Mittelmeier T., Moroney JV., Moseley J., Napoli C., Nedelcu AM., Niyogi K., Novoselov SV., Paulsen IT., Pazour G., Purton S., Ral JP., Riaño-Pachón DM., Riekhof W., Rymarquis L., Schroda M., Stern D., Umen J., Willows R., Wilson N., Zimmer SL., Allmer J., Balk J., Bisova K., Chen CJ., Elias M., Gendler K., Hauser C., Lamb MR., Ledford H., Long JC., Minagawa J., Page MD., Pan J., Pootakham W., Roje S., Rose A., Stahlberg E., Terauchi AM., Yang P., Ball S., Bowler C., Dieckmann CL., Gladyshev VN., Green P., Jorgensen R., Mayfield S., Mueller-Roeber B., Rajamani S., Sayre RT., Brokstein P., Dubchak I., Goodstein D., Hornick L., Huang YW., Jhaveri J., Luo Y., Martínez D., Ngau WC., Otillar B., Poliakov A., Porter A., Szajkowski L., Werner G., Zhou K., Grigoriev IV., Rokhsar DS., Grossman AR. The Chlamydomonas genome reveals the evolution of key animal and plant functions.. „Science”. Oct 12;318. 5848, s. 245-50, 2007. DOI: 10.1126/science.1143609. PMID: 17932292.
  3. The Chlamydomonas Genome Reveals the Evolution of Key Animal and Plant Functions | Science, science.sciencemag.org [dostęp 2017-11-22] (ang.).
  4. The Chlamydomonas reinhardtii Plastid Chromosome: Islands of Genes in a Sea of Repeats | Plant Cell, www.plantcell.org [dostęp 2017-11-22] (ang.).
licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Autorzy i redaktorzy Wikipedii
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia POL

Chlamydomonas reinhardtii: Brief Summary ( polonais )

fourni par wikipedia POL

Chlamydomonas reinhardtii – jednokomórkowa zielenica o średnicy 10 μm, pływająca przy pomocy dwóch wici.

Występowanie i budowa podobna do innych zielenic rodzaju zawłotnia (Chlamydomonas). Występuje w pospolicie wodach słodkich, wilgotnych glebach.

Szczep c137 (mt+) wyizolowany w 1945 r. w pobliżu Amherst, Massachusetts, USA jest jednym z modelowych organizmów badań biologicznych.

Chlamydomonas reinhardtii posiada jeden chloroplast. Energię w świetle zdobywa poprzez fotosyntezę. W ciemności wykorzystuje octan jako źródło energii i węgla.

W nietypowym środowisku, gdy jest mało siarki i tlenu, a dużo miedzi, jej chloroplast może przełączyć szlak fotofosforylacji i wytwarzać wodór. Prowadzone są prace nad selekcją warunków i modyfikacją genetyczną by zwiększyć wytwarzanie wodoru w celu przemysłowej produkcji biowodoru. Glony są obiecującymi organizmami do produkcji 3 generacji biopaliw jednak bezpośrednia produkcja wodoru przez biofotolizę jest ciekawym rozwiązaniem bowiem pozwala omijać problemy z dokarmianiem CO2 glonów w fotoreaktorze.

licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Autorzy i redaktorzy Wikipedii
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia POL

Chlamydomonas reinhardtii ( portugais )

fourni par wikipedia PT

Chlamydomonas reinhardtii é uma alga verde unicelular móvel de cerca de 10 micrômetros de diâmetro que nada com dois flagelos. A espécie têm tido nomes escritos de formas diferentes devido a várias transliterações do nome a partir da língua russa: reinhardi, reinhardii e reinhardtii se referem à mesma espécie, C. reinhardtii Dangeard.[1]

Estas algas são comummente encontradas no solo e em água fresca. Elas possuem uma parede celular feita de glicoproteínas ricas em hidroxiprolina, um grande cloroplasto em forma de copo, um grande pirenoide, e uma sensibilidade maior a luz. Normal Chlamydomonas normais podem crescer em um meio simples de sais inorgânicos na luz, usando fotossíntese para prover energia. Podem também crescer em escuridão total usando acetato como a fonte de carbono para o catabolismo.

Referências

 title=
licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Autores e editores de Wikipedia
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia PT

Chlamydomonas reinhardtii: Brief Summary ( portugais )

fourni par wikipedia PT

Chlamydomonas reinhardtii é uma alga verde unicelular móvel de cerca de 10 micrômetros de diâmetro que nada com dois flagelos. A espécie têm tido nomes escritos de formas diferentes devido a várias transliterações do nome a partir da língua russa: reinhardi, reinhardii e reinhardtii se referem à mesma espécie, C. reinhardtii Dangeard.

Estas algas são comummente encontradas no solo e em água fresca. Elas possuem uma parede celular feita de glicoproteínas ricas em hidroxiprolina, um grande cloroplasto em forma de copo, um grande pirenoide, e uma sensibilidade maior a luz. Normal Chlamydomonas normais podem crescer em um meio simples de sais inorgânicos na luz, usando fotossíntese para prover energia. Podem também crescer em escuridão total usando acetato como a fonte de carbono para o catabolismo.

licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Autores e editores de Wikipedia
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia PT

Chlamydomonas reinhardtii ( turc )

fourni par wikipedia TR

Chlamydomonas reinhardtii iki kamçı ile yüzen, çap olarak yaklaşık 10 mikrometre boyutunda olan tek hücreli bir yeşil algdir. Geniş kupa şeklinde kloroplast, geniş bir pirenoit, ışığı algılayan bir kuşgözü ve zengin hidroksiprolin glikoproteinlerden oluşan bir hücre duvarına sahiptir. Dünya çapında toprak ve tatlı suda fazlaca bulunmasına rağmen, C. reinhardtii öncelikle biyolojinin birçok alt alanında model organizma olarak kullanılmaktadır. Aydınlatıldığında, organik karbon ve kimyasal enerji olmadan büyüyebilir ve bunlar sağlandığında karanlıkta da büyüyebilir. C. reinhardtii ayrıca biyofarmasötik ve biyoyakıt alanlarında bir hidrojen kaynağı olarak da kullanılmaktadır.

Tarihi

İsim Rusçadan harf çevirisi nedeniyle birçok farklı türde telaffuz edilmektedir. Reinhardi, reinhardii ve reinhardtii aynı türü, C. reinhardtii ifade etmektedir.[1]

Model organizma

Chlamydomonas hücre ve moleküler biyoloji alanında aşağıdaki gibi temel sorulara yanıt bulmak için model organizma olarak kullanılmaktadır.

  • Hücreler nasıl hareket eder?
  • Hücreler ışığa nasıl tepki verir?
  • Hücreler birbirini nasıl tanır?
  • Hücreler nasıl düzenli ve tekrarlanabilir kamçılı dalgabiçimleri oluşturabilir?
  • Hücreler kamçı uzunluklarını kontrol etmek için proteomlarını nasıl düzenler?
  • Hücreler mineral beslenme değişikliklerine nasıl tepki verir? (nitrojen, sülfür vb.)

C. reinhardtii'nin mutasyon geçirmiş birçok türünün olduğu bilinmektedir. Mutasyon geçirmiş bu türler kamçı hareketliliği, fotosentez veya protein sentezini de içeren bir dizi biyolojik sürecin incelenmesinde yararlı olmuştur. Chlamydomonaslar normalde tek kromozomlu olduklarından, melezler meydana gelmeden mutasyonun etkileri hemen görülmektedir.

2007'de C. reinhardtii 'nin tüm çekirdeksel genom dizilimi yayınlanmıştır.[2]

Channelrhodopsin-1, Channelrhodopsin-2 ve ışık kapılı katyon kanalı olarak çalışan proteinler orijinal olarak C. reinhardtii'den ayrı tutulmuştur.[3][4] Bu proteinler ve bunlar gibi diğerleri optogenetik alanında yaygın bir şekilde kullanılmaktadır.

Üreme

Reinhardtii türünün bitkisel hücreleri 17 kromozomlu haploidlerdir. Nitrojen yoksunluğunda, gametler gelişmeye başlar. İki çiftleşme türleri vardır. Bunlar görünüşleri aynı olan ve bir diploid zigot oluşturmak için kaynaşabilen mt(+) ve mt(-) alellerdir. Zigot kamçılı değildir ve toprakta türün uyuyan formu olarak görev yapar. Işıkta zigot mayoza uğrar ve bitkisel yaşam döngüsüne devam edecek olan dört kamçılı haploid hücre meydana getirir.

İdeal büyüme şartları altında, yavru hücreler bazen eski hücre duvarından ortama salınmadan önce iki veya üç kez karyokinez geçirebilir. Bu yüzden, tek bir büyüme teşebbüsü ana hücre başına dört veya sekiz yavru hücreyle sonuçlanabilir.

Bu tek hücreli yeşil algin hücre döngüsü gece ve gündüzün birbirini kovalamasına benzetilebilir. Geçiş veya bağlılık noktası olarak belirlenen bir noktadan sonra süreç ışığa bağımsızken, büyüme safhasında ışığa bağlıdır.[5]

Genetik

Birçok genomik kaynağın kamuya sunulmasıyla birlikte, model organizma olarak bu alge olan ilgi son zamanlarda artmıştır. Birleşik Devletler Enerji Bakanlığı, Joint Genome Enstitüsü tarafından hazırlanan Chlamydomonas nükleer dizilimi tasarısı "Chlre3" toplamda 120Mb boyutunda olan 1557 yapı iskelesinden oluşmaktadır. Neredeyse genomun yarısı her biri en az 1.6 Mb uzunluğunda olan 24 yapı iskelesinden oluşmaktadır. Nükleer genomun güncel derlemesi internette mevcuttur.[6]

The ~15.8 Kb mitokondriyal genom (veritabanı erişimi: NC_ 001638) NCBI veritabanında mevcuttur.[7] Tüm>200 Kb kloroplast genomu da internette mevcuttur.[8] Genomik dizilim bilgisinin yanında, cDNA kütüphanelerinde ve EST'lerde sentezlenmiş dizi bilgilerine de ulaşmak mümkündür. Yedi cDNA kütüphanesi çevrimiçi olarak mevcuttur.[9] Clemson University Genomics Enstitüsü'nden bir BAC (Bakteriyel Suni Kromozom) derlemesi satınalınabilmektedir.[10] Ayrıca>50 000[11] ve>160 000[12] EST'ye internette çevrimiçi ulaşılabilmektedir.

Evrim

Chlamydomonas evrimsel biyoloji ve ekolojinin farklı yönleri üzerinde çalışmak için kullanılmaktadır. Birçok doğal seçilim deneyi için tercih edilen bir oganizmadır çünkü; (1) jenerasyon süresi kısadır, (2) hem heterotrof hem de ototrof bir organizmadır, (3) seksüel ve aseksüel olarak çoğalabilir, (4) zaten hali hazırda zengin genetik bilgisi mevcuttur.

Chlamydomonas ile yapılmış evrimsel çalışmaların örnekleri seksüel üreme evrimini[13], mutasyonların uygunluk etkilerini[14] ve CO2'in farklı seviyelerindeki adaptasyon etkilerini içermektedir.[15]

DNA Transformasyon Yöntemleri

Gen transformasyonu kloroplasttaki homolog rekombinasyon ve çekirdekteki heterolog rekombinasyon ile meydana gelir. C. reinhardtii kloroplast genomu mikroprojektil partikül bombardımanı ya da her ne kadar çok etkili olmasa da cam boncuk ajitasyonu kullanılarak transforme edilebilir. Nükleer genom hem cam boncuk ajitasyonu ile hem de elektroporasyon yöntemi ile transforme edilmiştir. Biyolistik prosedür DNA'nın kloroplast genomuna girmesinin en etkili yolu olarak görülür. Bunun nedeni kloroplastın, mikroprojektile büyük bir hedef sağlayarak, hücrenin hacminin yarısından fazlasını kaplamasıdır. Elektroporasyon, DNA'yı nükleer genoma, cam boncuk yöntemi ile elde edilenden iki kat daha fazla maksimum transformasyon frekanslarıyla, yerleştirmede en etkili yol olarak görülmüştür.

Biyofarmasötik Üretim

Chlamydomonas reinhardtii memeli serum amiloid proteini, insan antikoru, insani vasküler endotelyal büyüme faktörü, potansiyel bir tedavi olan HPV 16 aşısı[16], sıtma aşısı[17] ve kanser tedavisinde kullanılmış kompleks psikotrop madde üretiminde kullanılır.[18]

Hidrojen Üretiminin Temiz Kaynağı

1939 yılında, o dönem Chicago Üniversitesi'ne atanmış olan Alman araştırmacı Hans Gaffron (1902–1979) tek hücreli yeşil alglerin hidrojen metabolizmasını keşfetmiştir. Chlamydomonas reinhardtii ve diğer bazı yeşil algler, belli şartlar altında, oksijen üretmeyi keser ve onun yerine hidrojen üretir. Sadece oksijen yokluğunda aktif olan hidrogenaz enzimi tarafından gerçekleştirilen bu reaksiyon kısa ömürlüdür. Bir dahaki 30 yıl boyunca Gaffron ve takımı algler tarafından yapılan bu fotosentez hidrojen üretiminin temel mekanikleri üzerinde çalışmıştır.[19]

Hidrojen üretimini arttırmak için, araştırmacılar tarafından kullanılan birkaç yöntem vardır.

  • Birincisi hidrogenazın fotosentezden ayrımıdır. Bu yöntem ile oksijen birikimi, hidrojen üretimini engelleyemez. Hidrogenaz enziminin yapısını değiştirerek bir adım daha ileri gidilirse, hidrogenazı, oksijene duyarsız yapmak mümkün hale gelir. Bu sürekli bir hidrojen üretimini mümkün kılar. Bu üretim için ihtiyaç duyulan elektron akımı, bu safhada, artık şeker üretiminden gelmez. Onun yerine kendi nişasta stoğundan alınır.[20]
  • İkinci yöntem ise hidrogenazın genetik manipülasyonu boyunca, geçici olarak fotosentez sürecinin kesilmesidir. Bu, oksijenin hidrojen üretimini durduracak bir seviyeye ulaşmasını engeller.[21]
  • Üçüncü yöntem (1950'de araştırmacılar tarafından başlıca araştırılmış yöntem) alg hücrelerinin fotosentetik aktivitesi tarafından üretilen O2'nin, kimyasal ya da mekanik olarak ortadan kaldırılmasıdır. Bunlar O2 emicilerini, eklenmiş indirgeyici kullanımını, durağan gazlar ile bakteri kültürlerinin tasfiyesini içerir.[22] Fakat bu yöntemler doğal olarak ölçülebilir değildir ve uygulamalı sistemlere uygulanmayabilir.
  • Dördüncü yöntem oksijen üretiminden hidrogenaz eylemini bakır tuzlar kullanarak ayırmaktır. Bu yöntem araştırma aşamasındadır.[23]

Kaynakça

  1. ^ http://megasun.bch.umontreal.ca/protists/chlamy/taxonomy.html
  2. ^ Merchant et al.; Prochnik, SE; Vallon, O; Harris, EH; Karpowicz, SJ; Witman, GB; Terry, A; Salamov, A et al. (2007). "The Chlamydomonas Genome Reveals the Evolution of Key Animal and Plant Functions". Science 318 (5848): 245–250. doi:10.1126/science.1143609. PMC 2875087. PMID [17932292https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17932292 17932292]
  3. ^ Nagel G, Ollig D, Fuhrmann M, et al. (June 28, 2002). "Channelrhodopsin-1: a light-gated proton channel in green algae". S cience 296 (5577): 2395–8. doi:10.1126/science.1072068. PMID 12089443.
  4. ^ Lagali PS, Balya D, Awatramani GB, Münch TA, Kim DS, Busskamp V, Cepko CL, Roska B (June 2008). "Light-activated channels targeted to ON bipolar cells restore visual function in retinal degeneration". Nature Neuroscience 11 (6): 667–75. doi:10.1038/nn.2117. PMID 18432197.
  5. ^ Oldenhof, H, Zachleder, V. and van den Ende, H. 2006. Blue- and red-light regulation of the cell cycle in Chlamydomonas reinhardtii (Chlorophyta). Eur. J. Phycol. 41: 313 - 320
  6. ^ http://genome.jgi-psf.org/Chlre3/Chlre3.home.html
  7. ^ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
  8. ^ http://www.chlamy.org/chloro/default.html
  9. ^ http://www.chlamy.org/libraries.html
  10. ^ https://www.genome.clemson.edu/
  11. ^ http://www.kazusa.or.jp/en/plant/chlamy/EST/
  12. ^ http://www.chlamy.org/search.html
  13. ^ Colegrave N. 2002. Sex releases the speed limit on evolution. Nature 420: 664-666.
  14. ^ De Visser et al. 1996 The effect of sex and deleterious mutations on fitness in Chlamydomonas. Proc. R. Soc. Lond. B 263-193-200.
  15. ^ Collins & Bell. 2004. Phenotypic consequences of 1,000 generations of selection at elevated CO2 in a green alga. Nature 431: 566-569.
  16. ^ Demurtas OC, Massa S, Ferrante P, Venuti A, Franconi R, et al. (2013) A Chlamydomonas-Derived Human Papillomavirus 16 E7 Vaccine Induces SpecificTumor Protection. PLoS ONE 8(4): e61473. doi:10.1371/journal.pone.0061473
  17. ^ (16 May 2012) Biologists produce potential malarial vaccine from algae PhysOrg, Retrieved 15 April 2013
  18. ^ (10 December 2012) Engineering algae to make complex anti-cancer 'designer' drug PhysOrg, Retrieved 15 April 2013
  19. ^ Anastasios Melis, Thomas Happe (2004). "Trails of green alga hydrogen research — from Hans Gaffron to new frontiers". Photosynthesis Research 80 (1–3): 401–409. doi:10.1023/B:PRES.0000030421.31730.cb. PMID 16328836.
  20. ^ Laurent Cournac, Florence Musa, Laetitia Bernarda, Geneviève Guedeneya, Paulette Vignaisb and Gilles Peltie (2002). "Limiting steps of hydrogen production in Chlamydomonas reinhardtii and Synechocystis PCC 6803 as analysed by light-induced gas exchange transients". International Journal of Hydrogen Energy 27 (11/12): 1229–1237. doi:10.1016/S0360-3199(02)00105-2.
  21. ^ Anastasios Melis. "Hydrogen and hydrocarbon biofuels production via microalgal photosynthesis". Retrieved 2008-04-07.
  22. ^ Kosourov, S. Tsyganov, A. Seibert, Ghirardi, M. "Sustained Hydrogen Photoproduction by Chlamydomonas reinhardtii:Effects of Culture Parameters". Retrieved 2012-04-06.
  23. ^ Fernandez VM, Rua ML, Reyes P, Cammack R, Hatchikian EC. "Inhibition of Desulfovibrio gigas hydrogenase with copper salts and other metal ions.". Retrieved 2013-04-01.
licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Wikipedia yazarları ve editörleri
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia TR

Chlamydomonas reinhardtii: Brief Summary ( turc )

fourni par wikipedia TR

Chlamydomonas reinhardtii iki kamçı ile yüzen, çap olarak yaklaşık 10 mikrometre boyutunda olan tek hücreli bir yeşil algdir. Geniş kupa şeklinde kloroplast, geniş bir pirenoit, ışığı algılayan bir kuşgözü ve zengin hidroksiprolin glikoproteinlerden oluşan bir hücre duvarına sahiptir. Dünya çapında toprak ve tatlı suda fazlaca bulunmasına rağmen, C. reinhardtii öncelikle biyolojinin birçok alt alanında model organizma olarak kullanılmaktadır. Aydınlatıldığında, organik karbon ve kimyasal enerji olmadan büyüyebilir ve bunlar sağlandığında karanlıkta da büyüyebilir. C. reinhardtii ayrıca biyofarmasötik ve biyoyakıt alanlarında bir hidrojen kaynağı olarak da kullanılmaktadır.

licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Wikipedia yazarları ve editörleri
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia TR

Chlamydomonas reinhardtii ( vietnamien )

fourni par wikipedia VI

Chlamydomonas reinhardtii là một loài tảo trong họ Chlamydomonadaceae, thuộc chi Chlamydomonas.[1]

Hình ảnh

Chú thích

Tham khảo

Liên kết ngoài

 src= Phương tiện liên quan tới Chlamydomonas reinhardtii tại Wikimedia Commons

Hình tượng sơ khai Bài viết liên quan đến tảo này vẫn còn sơ khai. Bạn có thể giúp Wikipedia bằng cách mở rộng nội dung để bài được hoàn chỉnh hơn.
licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Wikipedia tác giả và biên tập viên
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia VI

Chlamydomonas reinhardtii: Brief Summary ( vietnamien )

fourni par wikipedia VI

Chlamydomonas reinhardtii là một loài tảo trong họ Chlamydomonadaceae, thuộc chi Chlamydomonas.

licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Wikipedia tác giả và biên tập viên
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia VI

Хламидомонада Рейнгардта ( russe )

fourni par wikipedia русскую Википедию
Царство: Растения
Подцарство: Зелёные растения
Семейство: Хламидомонадовые
Вид: Хламидомонада Рейнгардта
Международное научное название

Chlamydomonas reinhardtii P.A.Dang., 1888

Wikispecies-logo.svg
Систематика
на Викивидах
Commons-logo.svg
Изображения
на Викискладе
ITIS 180784NCBI 3055EOL 921552

Хламидомонада Рейнгардта (лат. Chlamydomonas reinhardtii) — это подвижная одноклеточная зелёная водоросль, представитель рода хламидомонада (Chlamydomonas). Эти водоросли широко распространены в почве и пресной воде.

Диаметр клетки около 10 микрометров, плавает при помощи двух одинаковых (равных) жгутиков, расположенных на суженном переднем конце. Возле основания жгутиков имеются две небольшие сократительные вакуоли. Основной компонент клеточной стенки — гликопротеины, богатые гидроксипролином. В клеточной стенке также присутствует растворимая фракция моносахаридов и олигосахаридов. Вопреки данным ранних работ, целлюлоза в ней отсутствует. Хлоропласт крупный, чашеобразный, содержит крупный пиреноид и светочувствительный глазок (стигму). Обычные (немутантные) штаммы Chlamydomonas могут расти на простой культуральной среде, содержащей неорганические соли, на свету используя фотосинтез для обеспечения клетки энергией. Также могут расти в полной темноте, используя в качестве источника углерода ацетат.

С. reinhardtii, так же как и другие представители рода Chlamydomonas, имеет сложный жизненный цикл. Гаплоидные вегетативные клетки размножаются митозом. В условиях недостатка питательных веществ (например, азота) они многократно делятся митозом, образуя половые клетки — гаметы. Затем разнородные гаметы попарно сливаются, образуя диплоидные зиготы. Зигота окружена плотной клеточной стенкой, что позволяет пережить неблагоприятное время. При наступлении благоприятных для жизни условий зигота делится мейозом на 4 гаплоидные вегетативные клетки.

Штамм C. reinhardtii дикого типа c137 (mt+) происходит из образца, взятого около Amherst, Massachusetts, в 1945 году.

Модельный организм

Chlamydomonas используется как модельный организм для исследования фундаментальных вопросов клеточной биологии и молекулярной биологии:

  • Как передвигаются клетки
  • Как клетки реагируют на свет
  • Как клетки распознают друг друга
  • Как клетки контролируют длину жгутика
  • Как клетки отвечают на изменения концентрации минеральных веществ (азот, сера…)

Известно много мутантов C. reinhardtii, которые являются удобными объектами для исследования различных биологических процессов — подвижности жгутика, фотосинтеза или биосинтеза белка. Так как вегетативные клетки Chlamydomonas в норме гаплоидны, эффекты мутаций проявляются без необходимости последующих скрещиваний.

В 2007 году была опубликована полная последовательность нуклеотидов генома C. reinhardtii.[1]

Ссылки

Примечания

  1. Merchant; et al. (2007). “The Chlamydomonas genome reveals the evolution of key animal and plant functions”. Science. 318: 245—250. DOI:10.1126/science.1143609. PMID 17932292.
Улучшение статьи
Для улучшения этой статьи желательно:
licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Авторы и редакторы Википедии

Хламидомонада Рейнгардта: Brief Summary ( russe )

fourni par wikipedia русскую Википедию

Хламидомонада Рейнгардта (лат. Chlamydomonas reinhardtii) — это подвижная одноклеточная зелёная водоросль, представитель рода хламидомонада (Chlamydomonas). Эти водоросли широко распространены в почве и пресной воде.

Диаметр клетки около 10 микрометров, плавает при помощи двух одинаковых (равных) жгутиков, расположенных на суженном переднем конце. Возле основания жгутиков имеются две небольшие сократительные вакуоли. Основной компонент клеточной стенки — гликопротеины, богатые гидроксипролином. В клеточной стенке также присутствует растворимая фракция моносахаридов и олигосахаридов. Вопреки данным ранних работ, целлюлоза в ней отсутствует. Хлоропласт крупный, чашеобразный, содержит крупный пиреноид и светочувствительный глазок (стигму). Обычные (немутантные) штаммы Chlamydomonas могут расти на простой культуральной среде, содержащей неорганические соли, на свету используя фотосинтез для обеспечения клетки энергией. Также могут расти в полной темноте, используя в качестве источника углерода ацетат.

С. reinhardtii, так же как и другие представители рода Chlamydomonas, имеет сложный жизненный цикл. Гаплоидные вегетативные клетки размножаются митозом. В условиях недостатка питательных веществ (например, азота) они многократно делятся митозом, образуя половые клетки — гаметы. Затем разнородные гаметы попарно сливаются, образуя диплоидные зиготы. Зигота окружена плотной клеточной стенкой, что позволяет пережить неблагоприятное время. При наступлении благоприятных для жизни условий зигота делится мейозом на 4 гаплоидные вегетативные клетки.

Штамм C. reinhardtii дикого типа c137 (mt+) происходит из образца, взятого около Amherst, Massachusetts, в 1945 году.

licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Авторы и редакторы Википедии